More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3213 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3213  major facilitator transporter  100 
 
 		 449 aa  877    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1709  major facilitator transporter  92.13 
 
 		 446 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4301  major facilitator transporter  90.6 
 
 		 451 aa  688    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0937604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0430  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  64.42 
 
 		 442 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4048  major facilitator transporter  62.1 
 
 		 442 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707986  normal  0.777424 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4062  major facilitator transporter  65.57 
 
 		 456 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4304  major facilitator transporter  65.57 
 
 		 456 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72099  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3214  major facilitator transporter  65.94 
 
 		 450 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1710  major facilitator transporter  65.48 
 
 		 449 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4302  major facilitator transporter  65.71 
 
 		 449 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392665  normal  0.708279 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3722  major facilitator transporter  63.89 
 
 		 459 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390654  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4198  major facilitator transporter  64.76 
 
 		 459 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0649203  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4220  major facilitator transporter  63.47 
 
 		 440 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0341  major facilitator transporter  62.44 
 
 		 453 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  47.06 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  45.08 
 
 		 454 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  44.32 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2785  d-galactonate transporter  42.56 
 
 		 448 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.0710234 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4964  d-galactonate transporter  42.56 
 
 		 448 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169087  normal  0.027359 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4780  d-galactonate transporter  44.12 
 
 		 444 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  43.45 
 
 		 444 aa  358  8e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  45.65 
 
 		 437 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 		 444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  43.29 
 
 		 446 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1075  major facilitator transporter  42.6 
 
 		 474 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.561566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 439 aa  353  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  43.2 
 
 		 439 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  44.36 
 
 		 442 aa  351  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  44.66 
 
 		 441 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 434 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.72 
 
 		 439 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4811  d-galactonate transporter  42.15 
 
 		 448 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00271172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 428 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 443 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 434 aa  349  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 434 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 434 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 434 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 434 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 428 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  44.22 
 
 		 439 aa  347  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 441 aa  345  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  44.12 
 
 		 429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  45.43 
 
 		 433 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  43.66 
 
 		 436 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  44.93 
 
 		 434 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 441 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 443 aa  342  7e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  42.79 
 
 		 440 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  42.79 
 
 		 469 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  42.79 
 
 		 440 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  42.79 
 
 		 440 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  42.79 
 
 		 440 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.79 
 
 		 440 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 441 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 441 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  42.63 
 
 		 440 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1965  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 459 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.683879  normal  0.501277 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  47.77 
 
 		 443 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4083  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 		 462 aa  336  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6711  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 442 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6476  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 442 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  39.21 
 
 		 441 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3029  major facilitator transporter  45.09 
 
 		 448 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82994  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  42.08 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  41.46 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  41.83 
 
 		 469 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 441 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 436 aa  332  7.000000000000001e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 440 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 445 aa  330  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  43.06 
 
 		 435 aa  330  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  39.77 
 
 		 441 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  42.79 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5122  major facilitator transporter  44.34 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  39.77 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  43.69 
 
 		 424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1431  major facilitator superfamily MFS_1  42.23 
 
 		 432 aa  326  5e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  39.77 
 
 		 440 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 437 aa  325  7e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 442 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 442 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 454 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3379  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  43.3 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  42.92 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 442 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1635  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000373492  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1058  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  40.68 
 
 		 443 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 435 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  42.96 
 
 		 452 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  40.64 
 
 		 433 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>