More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6362 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_7029  major facilitator transporter  99.05 
 
 		 526 aa  1017    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.97831  normal  0.626046 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4968  major facilitator transporter  81.18 
 
 		 529 aa  845    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6362  major facilitator transporter  100 
 
 		 526 aa  1027    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1466  major facilitator transporter  100 
 
 		 526 aa  1027    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127999  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1814  major facilitator superfamily MFS_1  41.17 
 
 		 522 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0912576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1623  putative transport protein (permease)  35.48 
 
 		 545 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3991  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.94 
 
 		 527 aa  256  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0208  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 527 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.54 
 
 		 529 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  29.2 
 
 		 519 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.4 
 
 		 527 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1156  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.84 
 
 		 524 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  28.98 
 
 		 499 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.6 
 
 		 540 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.63 
 
 		 517 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.06 
 
 		 516 aa  191  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1333  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 535 aa  190  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.67 
 
 		 539 aa  190  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.1 
 
 		 539 aa  190  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2527  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 522 aa  190  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.18 
 
 		 526 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4577  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 513 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27430  putative multidrug efflux MFS transporter  31.09 
 
 		 530 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.700486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1271  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 513 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1705  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 553 aa  184  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.05 
 
 		 536 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 516 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0872  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 513 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.2 
 
 		 543 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.85 
 
 		 516 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.85 
 
 		 516 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2500  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 577 aa  180  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.706515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.56 
 
 		 523 aa  179  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5000  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 535 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159102 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3380  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 509 aa  179  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.188058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4454  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 513 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.544324  normal  0.740147 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  26.18 
 
 		 534 aa  178  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.52 
 
 		 535 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.33 
 
 		 535 aa  177  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2303  major facilitator superfamily MFS_1  28.55 
 
 		 545 aa  176  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292812  normal  0.0663224 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.33 
 
 		 535 aa  176  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.97 
 
 		 538 aa  176  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00900  inner membrane multidrug resistance transmembrane protein  32.29 
 
 		 498 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.2 
 
 		 542 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.69 
 
 		 542 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.2 
 
 		 542 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.69 
 
 		 542 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1697  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 499 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2320  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 544 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0793665  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46380  major facilitator superfamily protein  29.94 
 
 		 518 aa  172  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2125  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 537 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.69 
 
 		 535 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.46 
 
 		 527 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.95 
 
 		 519 aa  167  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.46 
 
 		 504 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0142  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.1 
 
 		 526 aa  161  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  28.17 
 
 		 524 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  26.45 
 
 		 539 aa  160  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4488  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 541 aa  160  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.94 
 
 		 527 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.94 
 
 		 527 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  27.11 
 
 		 529 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.55 
 
 		 527 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.91 
 
 		 530 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.84 
 
 		 514 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  26.38 
 
 		 503 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.87 
 
 		 528 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.87 
 
 		 528 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.87 
 
 		 528 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.53 
 
 		 528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354181 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26 
 
 		 526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.92 
 
 		 528 aa  135  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.6 
 
 		 515 aa  133  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.33 
 
 		 528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.58 
 
 		 523 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.92 
 
 		 529 aa  131  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.83 
 
 		 535 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  27.24 
 
 		 508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  27.5 
 
 		 528 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.71 
 
 		 516 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.26 
 
 		 515 aa  127  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1077  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.71 
 
 		 523 aa  127  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1879  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.71 
 
 		 523 aa  127  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000219002  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.4 
 
 		 532 aa  127  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6435  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 509 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.16 
 
 		 520 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.8 
 
 		 537 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.92 
 
 		 543 aa  124  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.44 
 
 		 536 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.15 
 
 		 527 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.87 
 
 		 537 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.48 
 
 		 530 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
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NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.22 
 
 		 532 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.4 
 
 		 524 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.2 
 
 		 524 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal  1 
 
 
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NC_008835  BMA10229_1018  multidrug resistance protein  24.49 
 
 		 528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0111689  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.15 
 
 		 524 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.2 
 
 		 531 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401101  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.2 
 
 		 529 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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