41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3241 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3241  putative regulator  100 
 
 		 186 aa  342  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0950975 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 207 aa  88.2  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0147  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  36.41 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  42.71 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  35.43 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 234 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  38.82 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 237 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  37.97 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  29.94 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  38.36 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 		 237 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 238 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 258 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 258 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 237 aa  42.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 230 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38050  hypothetical protein  33.13 
 
 		 214 aa  42  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 221 aa  41.6  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>