22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0147 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0147  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  398  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3241  putative regulator  34.91 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0950975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 230 aa  48.5  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  31.38 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 224 aa  44.7  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 222 aa  41.6  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3882  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 190 aa  41.2  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>