More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3086 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3086  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 233 aa  450  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151774  normal  0.916258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  58.93 
 
 		 247 aa  264  7e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  61.82 
 
 		 321 aa  244  6.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  59.21 
 
 		 231 aa  231  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1090  two component transcriptional regulator  57.71 
 
 		 230 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0839689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.36 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  55.95 
 
 		 230 aa  225  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1193  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.34 
 
 		 240 aa  218  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  53.57 
 
 		 232 aa  211  9e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2015  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.23 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8286  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.88 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691187  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  45.22 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.29 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 235 aa  198  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0703  two component transcriptional regulator  54.05 
 
 		 237 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  44.78 
 
 		 235 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  44.78 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  44.78 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  44.78 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  44.78 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  44.78 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0709  two component transcriptional regulator  54.05 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  44.78 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0723  two component transcriptional regulator  54.05 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0244444 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  44.78 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 		 235 aa  195  5.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0035  two component transcriptional regulator  53.6 
 
 		 236 aa  195  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475833  normal  0.306601 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 230 aa  194  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.09 
 
 		 233 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.36 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.23 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.14 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0402  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  51.6 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 230 aa  192  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 237 aa  191  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.75 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  46.9 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  46.9 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  46.46 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.83 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  49.78 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.92 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  46.12 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  46.46 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  46.46 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  46.46 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.65 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  46.46 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  46.46 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  46.46 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1104  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 242 aa  188  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  47.51 
 
 		 226 aa  188  5e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 235 aa  188  5e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 246 aa  189  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  46.46 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.14 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  44.39 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1765  two component transcriptional regulator  52.05 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  44.64 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0885  two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.86 
 
 		 238 aa  185  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.8 
 
 		 225 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 233 aa  185  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 229 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 237 aa  185  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 227 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  48.94 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 		 231 aa  185  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>