More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2688 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2688  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
452 aa  871    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.70388  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.81 
 
 
462 aa  269  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.81 
 
 
462 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  39.81 
 
 
462 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  41.45 
 
 
459 aa  264  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.9 
 
 
460 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.71 
 
 
473 aa  257  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  37.72 
 
 
596 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.05 
 
 
462 aa  221  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2915  FAD linked oxidase domain protein  41.26 
 
 
455 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000548663  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  37.76 
 
 
467 aa  209  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  33.49 
 
 
462 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1621  FAD linked oxidase domain protein  36.14 
 
 
468 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  35.44 
 
 
470 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3564  FAD linked oxidase domain protein  41.16 
 
 
460 aa  197  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.293473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6967  oxidoreductase, FAD-dependent  37.35 
 
 
460 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  36.84 
 
 
465 aa  182  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  31.71 
 
 
459 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.96 
 
 
484 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  36.68 
 
 
474 aa  172  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  33.19 
 
 
436 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  32.3 
 
 
469 aa  159  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  29.36 
 
 
499 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  29 
 
 
478 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  29.41 
 
 
473 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  35.03 
 
 
449 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  33.77 
 
 
456 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  30.62 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  35.93 
 
 
479 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  26.99 
 
 
458 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  28.1 
 
 
461 aa  143  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0394  FAD linked oxidase domain protein  34.5 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  35.93 
 
 
479 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  30.11 
 
 
463 aa  140  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  30.65 
 
 
476 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.23 
 
 
461 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.1 
 
 
436 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.6 
 
 
478 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  28.86 
 
 
465 aa  137  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.65 
 
 
472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  27.31 
 
 
479 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  30.07 
 
 
465 aa  132  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  30.54 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  27.49 
 
 
461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  34.11 
 
 
439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  29.8 
 
 
460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  28.74 
 
 
477 aa  130  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  35.42 
 
 
458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  33.12 
 
 
465 aa  127  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.34 
 
 
461 aa  126  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.5 
 
 
465 aa  126  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  26.99 
 
 
456 aa  126  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.26 
 
 
464 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  31 
 
 
479 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  33.9 
 
 
450 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  27.63 
 
 
456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  31.68 
 
 
473 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.38 
 
 
734 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  33.26 
 
 
446 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  33.02 
 
 
764 aa  117  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  28.57 
 
 
461 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  31.53 
 
 
754 aa  116  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.31 
 
 
472 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  29.37 
 
 
477 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.54 
 
 
726 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  34.11 
 
 
461 aa  113  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  28.79 
 
 
465 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  28.03 
 
 
473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  31 
 
 
752 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  27.7 
 
 
466 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.93 
 
 
444 aa  110  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  31.46 
 
 
462 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.19 
 
 
469 aa  109  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  33.62 
 
 
758 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  25.28 
 
 
470 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2207  FAD linked oxidase domain protein  36.8 
 
 
456 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  30.79 
 
 
462 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.23 
 
 
481 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  31.47 
 
 
447 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  35.56 
 
 
465 aa  103  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  32.1 
 
 
463 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  29.89 
 
 
753 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  35.33 
 
 
448 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02387  conserved hypothetical protein  24.49 
 
 
502 aa  100  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.870175 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  29.45 
 
 
472 aa  99  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  30.32 
 
 
466 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  27.8 
 
 
602 aa  96.7  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  32.4 
 
 
563 aa  94.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  30.97 
 
 
473 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  31.34 
 
 
448 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.43 
 
 
474 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  34.95 
 
 
775 aa  88.6  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.19 
 
 
448 aa  86.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05258  conserved hypothetical protein  27.73 
 
 
502 aa  86.7  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10930  FAD-dependent oxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00840)  34.15 
 
 
501 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.304326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  26 
 
 
466 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  30.24 
 
 
705 aa  84.7  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
480 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  39.18 
 
 
436 aa  83.6  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10402  FAD-binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03300)  29.49 
 
 
500 aa  83.6  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0469697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>