36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0233 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0233  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 328 aa  626  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.86 
 
 		 340 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26820  hypothetical protein  37.31 
 
 		 352 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.873758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.78 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10000  hypothetical protein  31.11 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  33.04 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0452  hypothetical protein  21.55 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.37 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.83 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  28.19 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.47 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  28.82 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.46 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.44 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.21 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  29.33 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.25 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.05 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3447  integral membrane protein  40.65 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.25 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.1 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.43 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.16 
 
 		 341 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1156  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.98 
 
 		 370 aa  50.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.876276  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 		 323 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.33 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.85 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.6 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.85 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0327  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.34 
 
 		 391 aa  47  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.552069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.5 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.62 
 
 		 356 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.74 
 
 		 288 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.63 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>