More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0495 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0495  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 293 aa  586  1e-166  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0773  30S ribosomal protein S3  54.42 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127701  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  52.13 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2251  30S ribosomal protein S3  51.66 
 
 		 213 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000614716  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0329  ribosomal protein S3  48.87 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000625588  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  46.85 
 
 		 256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  49.52 
 
 		 245 aa  211  9e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3917  ribosomal protein S3  47.23 
 
 		 288 aa  211  9e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1914  ribosomal protein S3  48.34 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  46.92 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4309  ribosomal protein S3  47.23 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395435  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0574  ribosomal protein S3  48.34 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  46.92 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2168  ribosomal protein S3  47.87 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  48.34 
 
 		 241 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0666  30S ribosomal protein S3  48.15 
 
 		 213 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00146093  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2446  ribosomal protein S3  47.87 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2129  ribosomal protein S3  47.87 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.429997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2318  ribosomal protein S3  47.32 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00326782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0347  ribosomal protein S3  48.34 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.924426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  49.52 
 
 		 278 aa  210  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  47.39 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  48.34 
 
 		 223 aa  209  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  49.07 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2224  ribosomal protein S3  47.87 
 
 		 248 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0085  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 213 aa  209  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0561951 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  48.64 
 
 		 218 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2768  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 212 aa  209  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000286487  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  50 
 
 		 220 aa  209  6e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  46.45 
 
 		 243 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  46.54 
 
 		 234 aa  208  9e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  47.87 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1347  30S ribosomal protein S3  46.01 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  48.25 
 
 		 395 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  48.61 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  50.68 
 
 		 221 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 244 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  48.34 
 
 		 236 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  46.12 
 
 		 226 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  48.34 
 
 		 236 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  48.34 
 
 		 236 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  45.45 
 
 		 241 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  49.53 
 
 		 228 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  48.18 
 
 		 218 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  46.45 
 
 		 243 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  49.53 
 
 		 228 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  49.29 
 
 		 219 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6608  ribosomal protein S3  43.88 
 
 		 275 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  47.3 
 
 		 226 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  47.87 
 
 		 235 aa  206  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2163  ribosomal protein S3  48.61 
 
 		 226 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0196191  normal  0.200155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  51.18 
 
 		 210 aa  205  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  46.03 
 
 		 244 aa  205  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  46.15 
 
 		 217 aa  205  7e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0694  ribosomal protein S3  43.88 
 
 		 282 aa  205  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0937  30S ribosomal protein S3  46.29 
 
 		 292 aa  205  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  48.82 
 
 		 219 aa  205  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  47.51 
 
 		 217 aa  205  7e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0191  30S ribosomal protein S3  44.81 
 
 		 240 aa  205  8e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.339095 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0773  30S ribosomal protein S3  45.7 
 
 		 286 aa  205  8e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000686898  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  49.76 
 
 		 229 aa  205  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  47.06 
 
 		 217 aa  205  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  47.06 
 
 		 217 aa  205  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  48.4 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1759  30S ribosomal protein S3  48.34 
 
 		 212 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.341094  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  47.06 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0475  30S ribosomal protein S3  49.06 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00134596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 211 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0397  30S ribosomal protein S3  44.86 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  48.1 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4907  30S ribosomal protein S3  46.73 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0459562  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  47.87 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  48.34 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  48.58 
 
 		 228 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  48.58 
 
 		 228 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  48.83 
 
 		 214 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  48.58 
 
 		 228 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3995  30S ribosomal protein S3  48.11 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1962  ribosomal protein S3  48.82 
 
 		 237 aa  204  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.180974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 211 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  45.18 
 
 		 252 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3816  30S ribosomal protein S3  48.11 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000890302  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  51.64 
 
 		 230 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  49.06 
 
 		 228 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  47.62 
 
 		 227 aa  203  3e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4349  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122787  normal  0.048354 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  47.62 
 
 		 227 aa  203  3e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  48.34 
 
 		 210 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  49.06 
 
 		 228 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  49.06 
 
 		 228 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  49.29 
 
 		 229 aa  203  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2812  30S ribosomal protein S3  43.88 
 
 		 235 aa  203  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04040  SSU ribosomal protein S3P  46.95 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  49.06 
 
 		 228 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0326  30S ribosomal protein S3  45.89 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364603  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  47.87 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3437  30S ribosomal protein S3  45.28 
 
 		 299 aa  202  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0722902  normal  0.23465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4538  30S ribosomal protein S3  48.11 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  48.34 
 
 		 229 aa  202  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  45.97 
 
 		 341 aa  202  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>