More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6110 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0276  alpha/beta hydrolase fold  88.77 
 
 		 434 aa  644    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5871  alpha/beta hydrolase fold  98.94 
 
 		 376 aa  758    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5525  alpha/beta hydrolase fold  87.98 
 
 		 367 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6110  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 376 aa  766    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173305  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5889  alpha/beta hydrolase fold  87.98 
 
 		 367 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159226  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6398  alpha/beta hydrolase fold  85.79 
 
 		 367 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2842  alpha/beta hydrolase fold  87.13 
 
 		 434 aa  628  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9230  epoxide hydrolase  77.84 
 
 		 371 aa  587  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7125  putative epoxide hydrolase  57.46 
 
 		 356 aa  391  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  50.67 
 
 		 390 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  33.97 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  30.91 
 
 		 315 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.77 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 351 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 		 337 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  32.44 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  31.88 
 
 		 356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  33.97 
 
 		 315 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  33.97 
 
 		 315 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 341 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 323 aa  136  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  31.99 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 		 330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  27.93 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 312 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  29.27 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  44.19 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  48.18 
 
 		 302 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  27.25 
 
 		 331 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  39.39 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 		 315 aa  92  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  42.19 
 
 		 311 aa  90.1  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  37.12 
 
 		 283 aa  89.7  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  39.53 
 
 		 308 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  44.96 
 
 		 297 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  47.29 
 
 		 307 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  47.29 
 
 		 294 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  38.76 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  44.19 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  38.76 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  41.13 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 		 287 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  37.31 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  41.13 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  41.13 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  41.6 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  39.84 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  38.76 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  40.94 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.81 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  39.06 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  38.76 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  40.94 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  39.84 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  35.61 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  40.48 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0438  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.84 
 
 		 313 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  39.84 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  37.69 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  41.44 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  38.28 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2990  alpha/beta hydrolase fold protein  39.73 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  hitchhiker  0.00172435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  35.88 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  37.98 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6641  hypothetical protein  43.82 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>