174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5602 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5484  phosphatidylserine decarboxylase-related  80.24 
 
 		 413 aa  683    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000459221 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6081  phosphatidylserine decarboxylase-related  86.78 
 
 		 416 aa  739    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134121 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6332  phosphatidylserine decarboxylase-related  98.31 
 
 		 415 aa  851    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0687307 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1338  phosphatidylserine decarboxylase-related  86.78 
 
 		 437 aa  739    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305133  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5602  phosphatidylserine decarboxylase-related  100 
 
 		 415 aa  862    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6491  phosphatidylserine decarboxylase-related  87.02 
 
 		 437 aa  741    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00510821  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1997  putative phosphatidylserine decarboxylase  68.17 
 
 		 433 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1018  putative phosphatidylserine decarboxylase  68.17 
 
 		 433 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1306  putative phosphatidylserine decarboxylase  68.17 
 
 		 433 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3176  putative phosphatidylserine decarboxylase  67.92 
 
 		 430 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2283  putative phosphatidylserine decarboxylase  68.17 
 
 		 433 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.808737  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1394  phosphatidylserine decarboxylase precursor  68.21 
 
 		 433 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0076  putative phosphatidylserine decarboxylase  64.37 
 
 		 416 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.946324  hitchhiker  0.00170285 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3048  putative phosphatidylserine decarboxylase  68.46 
 
 		 433 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65507  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5255  phosphatidylserine decarboxylase-related  60.2 
 
 		 416 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410798 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1269  phosphatidylserine decarboxylase-related  39.5 
 
 		 436 aa  302  9e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00492454  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4860  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  39.89 
 
 		 430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0399088 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08120  Phosphatidylserine decarboxylase, putative  37.12 
 
 		 436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11161  phosphatidylserine decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01730)  36.73 
 
 		 446 aa  273  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4108  phosphatidylserine decarboxylase-related  34.38 
 
 		 456 aa  253  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1617  hypothetical protein  89.15 
 
 		 159 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0979  phosphatidylserine decarboxylase-related  33.74 
 
 		 474 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0966  phosphatidylserine decarboxylase-related  32.51 
 
 		 474 aa  203  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3578  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  27.95 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40695  phosphatidylserine decarboxylase  34.31 
 
 		 1064 aa  113  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  31.66 
 
 		 1264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04930  conserved hypothetical protein  35.29 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07385  conserved hypothetical protein  31.78 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03188  phosphatidylserine decarboxylase Psd2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13970)  28.57 
 
 		 1053 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.927453 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20791  hypothetical protein  25.22 
 
 		 397 aa  96.3  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0033  phosphatidylserine decarboxylase  28.76 
 
 		 294 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.484885  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0033  phosphatidylserine decarboxylase  26.35 
 
 		 294 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0072  phosphatidylserine decarboxylase  30.88 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1976  phosphatidylserine decarboxylase  30.73 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129589 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  26.95 
 
 		 300 aa  87  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1772  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  31.43 
 
 		 392 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.839794  normal  0.123461 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07989  phosphatidylserine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16930)  26.32 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1551  phosphatidylserine decarboxylase-related  25.59 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal  0.0668406 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1846  phosphatidylserine decarboxylase  30.19 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.028301 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4189  phosphatidylserine decarboxylase  29.03 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3064  phosphatidylserine decarboxylase  28.44 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3539  phosphatidylserine decarboxylase  24.9 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100756  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4419  phosphatidylserine decarboxylase  27.98 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4235  phosphatidylserine decarboxylase  27.98 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4565  phosphatidylserine decarboxylase  27.98 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4083  phosphatidylserine decarboxylase  27.98 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4360  phosphatidylserine decarboxylase  27.98 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4471  phosphatidylserine decarboxylase  27.98 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  28.44 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0779  phosphatidylserine decarboxylase  28.44 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00256748 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4073  phosphatidylserine decarboxylase  27.98 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.293375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0989  phosphatidylserine decarboxylase  29.25 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  28.02 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  28.02 
 
 		 292 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4458  phosphatidylserine decarboxylase  27.98 
 
 		 262 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.183359  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  28.02 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  28.1 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  30.32 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  27.6 
 
 		 289 aa  67  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1652  phosphatidylserine decarboxylase-related  30 
 
 		 298 aa  67  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.178004 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1332  phosphatidylserine decarboxylase  29.33 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  27.73 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0603  phosphatidylserine decarboxylase-related  28.83 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  27.23 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  29.11 
 
 		 610 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2692  phosphatidylserine decarboxylase-related  29.29 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  27.13 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  28.82 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  26.95 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  26.95 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  27.23 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  26.95 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  29.91 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  26.95 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  29.77 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  26.38 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  28 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1505  phosphatidylserine decarboxylase-related  30.28 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  29.91 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  26.05 
 
 		 288 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  29.75 
 
 		 294 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4806  phosphatidylserine decarboxylase  29.27 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  25.36 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  28.97 
 
 		 613 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  30.4 
 
 		 280 aa  59.3  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3747  phosphatidylserine decarboxylase  29.84 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1300  phosphatidylserine decarboxylase  27.88 
 
 		 294 aa  59.3  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  27.76 
 
 		 289 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  25 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  26.87 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4617  phosphatidylserine decarboxylase  26.87 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0883956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  26.87 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  26.67 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1961  phosphatidylserine decarboxylase-related  25 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.23874  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  26.87 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  26.34 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  25.68 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  30.56 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0824  phosphatidylserine decarboxylase  27.44 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.088312  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2301  phosphatidylserine decarboxylase  25.18 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>