174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6332 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6332  phosphatidylserine decarboxylase-related  100 
 
 		 415 aa  862    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0687307 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1338  phosphatidylserine decarboxylase-related  87.02 
 
 		 437 aa  742    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305133  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5602  phosphatidylserine decarboxylase-related  98.31 
 
 		 415 aa  851    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6491  phosphatidylserine decarboxylase-related  87.26 
 
 		 437 aa  744    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00510821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6081  phosphatidylserine decarboxylase-related  87.02 
 
 		 416 aa  743    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134121 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5484  phosphatidylserine decarboxylase-related  80.24 
 
 		 413 aa  681    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000459221 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1997  putative phosphatidylserine decarboxylase  68.17 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1018  putative phosphatidylserine decarboxylase  68.17 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1306  putative phosphatidylserine decarboxylase  68.17 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3176  putative phosphatidylserine decarboxylase  67.92 
 
 		 430 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2283  putative phosphatidylserine decarboxylase  68.17 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.808737  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1394  phosphatidylserine decarboxylase precursor  68.21 
 
 		 433 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0076  putative phosphatidylserine decarboxylase  63.88 
 
 		 416 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.946324  hitchhiker  0.00170285 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3048  putative phosphatidylserine decarboxylase  68.46 
 
 		 433 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65507  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5255  phosphatidylserine decarboxylase-related  60.2 
 
 		 416 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410798 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1269  phosphatidylserine decarboxylase-related  39.75 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00492454  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4860  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  39.89 
 
 		 430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0399088 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11161  phosphatidylserine decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01730)  36.73 
 
 		 446 aa  276  5e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08120  Phosphatidylserine decarboxylase, putative  37.68 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4108  phosphatidylserine decarboxylase-related  34.52 
 
 		 456 aa  247  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1617  hypothetical protein  89.15 
 
 		 159 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0979  phosphatidylserine decarboxylase-related  33.74 
 
 		 474 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0966  phosphatidylserine decarboxylase-related  32.76 
 
 		 474 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3578  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  28.22 
 
 		 417 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142154  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  31.66 
 
 		 1264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40695  phosphatidylserine decarboxylase  33.98 
 
 		 1064 aa  112  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04930  conserved hypothetical protein  35.29 
 
 		 409 aa  109  9.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07385  conserved hypothetical protein  30.62 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03188  phosphatidylserine decarboxylase Psd2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13970)  28.88 
 
 		 1053 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.927453 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20791  hypothetical protein  24.64 
 
 		 397 aa  94  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0072  phosphatidylserine decarboxylase  31.37 
 
 		 301 aa  89.7  8e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0033  phosphatidylserine decarboxylase  29.17 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.484885  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0033  phosphatidylserine decarboxylase  26.76 
 
 		 294 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  27.46 
 
 		 300 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1976  phosphatidylserine decarboxylase  30.24 
 
 		 306 aa  86.7  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1772  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  31.43 
 
 		 392 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.839794  normal  0.123461 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07989  phosphatidylserine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16930)  26.38 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1551  phosphatidylserine decarboxylase-related  24.92 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal  0.0668406 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4189  phosphatidylserine decarboxylase  28.57 
 
 		 262 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3064  phosphatidylserine decarboxylase  27.98 
 
 		 261 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1846  phosphatidylserine decarboxylase  29.72 
 
 		 284 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.028301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3539  phosphatidylserine decarboxylase  24.9 
 
 		 298 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100756  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  28.44 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4419  phosphatidylserine decarboxylase  27.52 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4235  phosphatidylserine decarboxylase  27.52 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4083  phosphatidylserine decarboxylase  27.52 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4565  phosphatidylserine decarboxylase  27.52 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0989  phosphatidylserine decarboxylase  29.25 
 
 		 264 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4360  phosphatidylserine decarboxylase  27.52 
 
 		 262 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4471  phosphatidylserine decarboxylase  27.52 
 
 		 262 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1652  phosphatidylserine decarboxylase-related  30.5 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.178004 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4073  phosphatidylserine decarboxylase  27.52 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.293375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0779  phosphatidylserine decarboxylase  27.98 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00256748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4458  phosphatidylserine decarboxylase  27.52 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.183359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0603  phosphatidylserine decarboxylase-related  29.28 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  30.32 
 
 		 286 aa  67  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  26.77 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  26.77 
 
 		 292 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  26.77 
 
 		 292 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  26.72 
 
 		 289 aa  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2692  phosphatidylserine decarboxylase-related  29.64 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  27.78 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  27.23 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  27.95 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1505  phosphatidylserine decarboxylase-related  30.33 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  27.23 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  29.77 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1332  phosphatidylserine decarboxylase  28.85 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  30.17 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  29.91 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  26.98 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  28.64 
 
 		 610 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  26.56 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  26.05 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  26.56 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  26.56 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  26.56 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4806  phosphatidylserine decarboxylase  29.27 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  27.76 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1961  phosphatidylserine decarboxylase-related  24.57 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.23874  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  27.04 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  27.42 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  25.12 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  26.34 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  29.75 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  29.44 
 
 		 286 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1300  phosphatidylserine decarboxylase  27.88 
 
 		 294 aa  59.3  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  26.07 
 
 		 325 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  30.56 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2301  phosphatidylserine decarboxylase  25.18 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  26.34 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2462  phosphatidylserine decarboxylase  24.65 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0788063  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  28.02 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3747  phosphatidylserine decarboxylase  29.03 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2796  phosphatidylserine decarboxylase  29.36 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  27.7 
 
 		 613 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  27.27 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  27.27 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  26.22 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>