More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6195 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6195  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
257 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107166  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3812  Crp/FNR family transcriptional regulator  95.72 
 
 
257 aa  517  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279241  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4280  Crp/FNR family transcriptional regulator  96.11 
 
 
257 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0900166 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5904  Crp/FNR family transcriptional regulator  93.77 
 
 
257 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379633  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0164  Crp/FNR family transcriptional regulator  73.98 
 
 
260 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1016  Crp/FNR family transcriptional regulator  73.98 
 
 
260 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2747  Crp/Fnr family transcriptional regulator  73.98 
 
 
260 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225266  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2604  Crp/Fnr family transcriptional regulator  73.98 
 
 
260 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  70.93 
 
 
260 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0190  Crp/FNR family transcriptional regulator  74.27 
 
 
242 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1334  Crp/FNR family transcriptional regulator  74.27 
 
 
242 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0129  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.9 
 
 
259 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1636  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.9 
 
 
259 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1554  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.9 
 
 
259 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1244  Crp/FNR family transcriptional regulator  74.24 
 
 
261 aa  363  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1138  Crp/FNR family transcriptional regulator  64.09 
 
 
260 aa  358  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5811  Crp/FNR family transcriptional regulator  69.01 
 
 
266 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5999  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.57 
 
 
259 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.582695  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4238  Crp/FNR family transcriptional regulator  61.48 
 
 
257 aa  342  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0460631  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4355  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.16 
 
 
259 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4012  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.16 
 
 
259 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1665  Crp/FNR family transcriptional regulator  64.03 
 
 
259 aa  340  9e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00239618  normal  0.130389 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3764  Crp/FNR family transcriptional regulator  64.85 
 
 
259 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4265  Crp/FNR family transcriptional regulator  63.9 
 
 
259 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367581  normal  0.892156 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  63.95 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0606  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.34 
 
 
267 aa  295  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149995 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3149  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.81 
 
 
249 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4272  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.96 
 
 
218 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71016  normal  0.563993 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1540  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.26 
 
 
630 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18142  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.26 
 
 
251 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0051  cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases  55.26 
 
 
251 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5008  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.6 
 
 
249 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0031  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.82 
 
 
251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0035  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.82 
 
 
251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.82 
 
 
251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284481  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1184  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.82 
 
 
251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1464  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.82 
 
 
251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855917  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1047  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  53.36 
 
 
247 aa  270  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3138  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.2 
 
 
248 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4433  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.13 
 
 
224 aa  270  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5297  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.42 
 
 
248 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4486  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.8 
 
 
248 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5122  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.19 
 
 
248 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5737  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.19 
 
 
248 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2772  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.26 
 
 
245 aa  265  7e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275745 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1147  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  56.56 
 
 
261 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1217  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  56.56 
 
 
261 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0190  transcription regulator protein  49.43 
 
 
266 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1530  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.95 
 
 
239 aa  259  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4428  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.65 
 
 
263 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4561  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.65 
 
 
263 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.291712 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1163  CRP/FNR family transcriptional regulator  50.21 
 
 
251 aa  257  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1007  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  53.36 
 
 
242 aa  256  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1091  CRP/FNR family transcriptional regulator  53.36 
 
 
247 aa  256  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.140321  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2782  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.47 
 
 
262 aa  254  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680307  normal  0.414614 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1288  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52 
 
 
246 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2471  transcription factor Fnr  56.05 
 
 
269 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.0435693 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4521  Crp/Fnr family transcriptional regulator  50.22 
 
 
257 aa  249  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0161618  normal  0.0108643 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3775  CRP/FNR family transcriptional regulator  50.22 
 
 
265 aa  247  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1170  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.21 
 
 
274 aa  239  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1207  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.67 
 
 
264 aa  237  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494469  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2510  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.33 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.6173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1937  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.3 
 
 
223 aa  229  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3345  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
247 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.797997  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4294  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.36 
 
 
272 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0460  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.11 
 
 
256 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0792  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
262 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.83 
 
 
256 aa  221  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0588975 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1204  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.25 
 
 
242 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1111  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.25 
 
 
242 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700786  normal  0.531022 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2037  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.441781 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1283  putative fumarate and nitrate reduction regulatory transcription regulator protein  44 
 
 
242 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0516193  normal  0.32826 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2034  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  43.3 
 
 
232 aa  217  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1666  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.18 
 
 
250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0506299  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
253 aa  207  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1811  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
244 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1799  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  38.59 
 
 
250 aa  201  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.417815  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4265  transcriptional regulator Anr  42.11 
 
 
244 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3583  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
244 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1603  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
244 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44490  transcriptional regulator Anr  43.06 
 
 
244 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3788  transcriptional regulator Anr  43.06 
 
 
244 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3830  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
244 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.525453 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1993  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.27 
 
 
249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.238952  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1991  transcriptional activator Anr  41.85 
 
 
244 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2417  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.27 
 
 
249 aa  199  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0646393  decreased coverage  0.000000159166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2356  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.34 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2311  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.59 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.144598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1788  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.59 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.765276  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1450  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.59 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3425  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  40.79 
 
 
244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1575  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.59 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2291  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.59 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2018  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  38.63 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1546  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.59 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1951  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.55 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.80493  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2219  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.27 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1961  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.91 
 
 
250 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0212  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.89 
 
 
254 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1981  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.59 
 
 
250 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>