120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1022 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  100 
 
 		 145 aa  288  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  98.62 
 
 		 145 aa  282  9e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1362  ribonuclease P  86.86 
 
 		 141 aa  217  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  58.47 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  56 
 
 		 133 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  56.1 
 
 		 133 aa  123  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  55.86 
 
 		 121 aa  120  7e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  54.17 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0375  ribonuclease P  58.12 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174091  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  34.82 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  35.43 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  44.21 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  38.6 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  35.4 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  37.96 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3075  ribonuclease P protein  42.31 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  35.92 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  43.96 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7325  ribonuclease P protein component  37.21 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0068  ribonuclease P protein component  42.34 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190277  decreased coverage  0.00398675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  34.82 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3704  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0684  ribonuclease P protein component  44.86 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  36.19 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  35.42 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  37.14 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  36.79 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  31.67 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  33.04 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  37.04 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1922  ribonuclease P protein component  38.74 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239501  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  34.23 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  34.86 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  40.24 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  39.24 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  39.34 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 122 aa  52  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0637  ribonuclease P protein component  40.38 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150092  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  39.73 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  33.93 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  31.43 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  39.13 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  37.97 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  31.4 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  31.4 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  31.4 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  31.4 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  31.4 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  31.4 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  45.95 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  31.4 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0818  ribonuclease P protein component  42.31 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  34.91 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  36.36 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  29.13 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  38.71 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  29.84 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  36.84 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  41.18 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  35.42 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  32.35 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  30.7 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  39.8 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  32.54 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  35.53 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  35.79 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  49.02 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  49.02 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  33.33 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  42.03 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  35.94 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  35.94 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2352  ribonuclease P protein component  35.66 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  48.89 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  32.71 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2631  ribonuclease P protein component  35.66 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88975  normal  0.0705179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  32.71 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  30.25 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  30.25 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  32.71 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  32.71 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  31.82 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2523  ribonuclease P protein component  49.18 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0265349  hitchhiker  0.0000065266 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  37.5 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4508  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 		 170 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  36.51 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  39.68 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  36.84 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  27.1 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  35.21 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  28.18 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  39.06 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  42.47 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  34.86 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>