263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0404 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0404  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  100 
 
 		 777 aa  1561    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0583  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  61.9 
 
 		 704 aa  909    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.496315 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2586  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.17 
 
 		 727 aa  778    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577877  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2759  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  64.61 
 
 		 704 aa  650    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3289  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  55.67 
 
 		 724 aa  722    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0726267  normal  0.258667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3329  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  55.46 
 
 		 733 aa  758    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0538  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  65.89 
 
 		 727 aa  997    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.533831  normal  0.300886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2357  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.71 
 
 		 701 aa  769    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306896  normal  0.223006 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1095  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.91 
 
 		 760 aa  783    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.729278  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0413  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  99.61 
 
 		 777 aa  1554    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2731  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.98 
 
 		 739 aa  655    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0985358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4348  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.98 
 
 		 728 aa  788    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314297  hitchhiker  0.00562302 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1109  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  53.43 
 
 		 737 aa  665    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1138  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  56.08 
 
 		 699 aa  734    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1239  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  54.86 
 
 		 760 aa  778    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1221  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  57.8 
 
 		 822 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  54.36 
 
 		 764 aa  768    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58245  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0956  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  63.97 
 
 		 764 aa  972    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4369  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  57.87 
 
 		 701 aa  805    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0714  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  65.66 
 
 		 789 aa  1040    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3416  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  63.04 
 
 		 696 aa  642    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.269984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0522  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  91.76 
 
 		 764 aa  1409    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3096  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  56.34 
 
 		 726 aa  756    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0466  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  66.02 
 
 		 721 aa  994    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0380  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  59.48 
 
 		 740 aa  922    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2310  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.36 
 
 		 687 aa  629  1e-179  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0644  glycine--tRNA ligase  48.32 
 
 		 758 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121642  normal  0.442369 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2402  glycyl-tRNA synthetase beta chain  48.02 
 
 		 720 aa  625  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0966728  normal  0.754916 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1858  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.14 
 
 		 697 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0507  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.14 
 
 		 697 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0540  glycine--tRNA ligase  48.01 
 
 		 685 aa  623  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0728  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  48.53 
 
 		 741 aa  616  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2126  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  57.61 
 
 		 821 aa  606  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2178  glycine--tRNA ligase  47.14 
 
 		 738 aa  597  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2175  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.28 
 
 		 728 aa  593  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.754598  normal  0.117585 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2111  glycine--tRNA ligase  43.03 
 
 		 738 aa  544  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4858  glycine--tRNA ligase  43.08 
 
 		 677 aa  513  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1611  glycine--tRNA ligase  43.14 
 
 		 723 aa  507  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2955  glycine--tRNA ligase  40.66 
 
 		 721 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2185  glycine--tRNA ligase  41.07 
 
 		 723 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0577  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.85 
 
 		 686 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0505087  hitchhiker  0.0000000000000536601 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.22 
 
 		 686 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.11 
 
 		 687 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.57 
 
 		 687 aa  392  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.57 
 
 		 687 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.42 
 
 		 690 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.71 
 
 		 697 aa  379  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.42 
 
 		 684 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.42 
 
 		 684 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.87 
 
 		 683 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.96 
 
 		 683 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  33.84 
 
 		 700 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_002978  WD0155  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.05 
 
 		 705 aa  366  1e-100  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.117933  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.61 
 
 		 687 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4177  glycine--tRNA ligase  35.18 
 
 		 708 aa  363  7.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.787875  normal  0.54331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.72 
 
 		 687 aa  362  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.6 
 
 		 684 aa  362  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.22 
 
 		 698 aa  361  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.44 
 
 		 689 aa  361  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  34.14 
 
 		 693 aa  361  3e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.75 
 
 		 697 aa  360  5e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.35855  normal  0.503298 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3535  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.84 
 
 		 712 aa  359  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.028288 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  33.29 
 
 		 695 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.06 
 
 		 689 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1289  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.95 
 
 		 704 aa  358  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.48 
 
 		 685 aa  357  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0400  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.73 
 
 		 697 aa  358  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.543468 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2347  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.11 
 
 		 701 aa  356  7.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0415  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.47 
 
 		 697 aa  356  7.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474954  normal  0.979484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.42 
 
 		 705 aa  356  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0716  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.18 
 
 		 699 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0701  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.18 
 
 		 699 aa  355  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2430  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.18 
 
 		 699 aa  354  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.726931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0218  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.18 
 
 		 699 aa  354  4e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2350  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.18 
 
 		 699 aa  354  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.18 
 
 		 699 aa  354  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.59966  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2728  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.18 
 
 		 699 aa  354  4e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.46 
 
 		 688 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.86 
 
 		 694 aa  353  7e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.95 
 
 		 688 aa  352  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  33.25 
 
 		 696 aa  350  4e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.58 
 
 		 688 aa  350  5e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.55 
 
 		 694 aa  350  7e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.87 
 
 		 684 aa  350  8e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.93 
 
 		 689 aa  349  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.23 
 
 		 684 aa  348  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  33.25 
 
 		 691 aa  346  8.999999999999999e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.1 
 
 		 684 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.03 
 
 		 689 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.65 
 
 		 688 aa  345  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.03 
 
 		 689 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.67 
 
 		 694 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.03 
 
 		 689 aa  345  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1773  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.36 
 
 		 697 aa  344  4e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0663369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0686  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.23 
 
 		 699 aa  343  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0163  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.9 
 
 		 689 aa  343  5e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0444  glycine--tRNA ligase  34.71 
 
 		 711 aa  343  5e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906989  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.9 
 
 		 689 aa  343  7e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.9 
 
 		 689 aa  343  7e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.9 
 
 		 689 aa  343  7e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>