More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1084 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3894  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.05 
 
 
471 aa  680    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.43 
 
 
478 aa  726    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  99.79 
 
 
487 aa  990    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.99 
 
 
479 aa  712    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.76 
 
 
482 aa  829    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.51 
 
 
473 aa  719    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.1 
 
 
477 aa  710    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.87 
 
 
480 aa  742    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.81 
 
 
479 aa  728    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.84 
 
 
473 aa  710    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  82.55 
 
 
481 aa  833    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.8 
 
 
472 aa  712    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.7 
 
 
473 aa  698    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.55 
 
 
477 aa  691    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.43 
 
 
479 aa  727    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.58 
 
 
479 aa  710    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.25 
 
 
480 aa  732    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.81 
 
 
478 aa  727    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.47 
 
 
487 aa  819    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.54 
 
 
473 aa  713    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
539 aa  1103    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  93.84 
 
 
487 aa  945    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  83.78 
 
 
481 aa  835    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  83.78 
 
 
481 aa  840    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.31 
 
 
486 aa  817    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.04 
 
 
466 aa  598  1e-170  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.52 
 
 
465 aa  583  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.62 
 
 
464 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.49 
 
 
468 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.91 
 
 
465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.03 
 
 
464 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.01 
 
 
465 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.7 
 
 
463 aa  574  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.83 
 
 
466 aa  568  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.04 
 
 
464 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2823  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.83 
 
 
465 aa  553  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.67 
 
 
470 aa  551  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.44 
 
 
465 aa  545  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.14 
 
 
465 aa  546  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.26 
 
 
469 aa  531  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.46 
 
 
465 aa  523  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.53 
 
 
474 aa  510  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.1 
 
 
466 aa  495  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.71 
 
 
466 aa  485  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.75 
 
 
468 aa  478  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.97 
 
 
465 aa  479  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  50.63 
 
 
457 aa  470  1.0000000000000001e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.65 
 
 
465 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.21 
 
 
462 aa  468  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  51.23 
 
 
464 aa  462  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.45 
 
 
462 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.04 
 
 
462 aa  459  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2779  dihydrolipoamide dehydrogenase E3 component of 3 enzyme complexes  48.04 
 
 
463 aa  451  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.285583  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.96 
 
 
468 aa  451  1e-125  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.45 
 
 
468 aa  440  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.6 
 
 
491 aa  427  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0853  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.53 
 
 
465 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50611  normal  0.0780472 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0435  hypothetical protein  47.17 
 
 
478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0273668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.07 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.05 
 
 
471 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.08 
 
 
464 aa  383  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.97 
 
 
473 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.84 
 
 
474 aa  383  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.44 
 
 
467 aa  379  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.65 
 
 
461 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.05 
 
 
471 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.42 
 
 
464 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.39 
 
 
468 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5475  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.44 
 
 
466 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67474  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.8 
 
 
466 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0463  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.17 
 
 
457 aa  367  1e-100  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.74 
 
 
467 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.78 
 
 
465 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.62 
 
 
464 aa  365  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.23 
 
 
469 aa  363  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.21 
 
 
466 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3518  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.83 
 
 
464 aa  363  4e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.76 
 
 
473 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.21 
 
 
466 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.21 
 
 
466 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.57 
 
 
467 aa  362  9e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0745  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.84 
 
 
461 aa  362  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.51 
 
 
473 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.53 
 
 
465 aa  356  5.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.39 
 
 
460 aa  355  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0114  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.01 
 
 
467 aa  353  4e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0247817 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.72 
 
 
473 aa  352  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.93 
 
 
472 aa  350  3e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.72 
 
 
473 aa  350  3e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.51 
 
 
473 aa  350  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.31 
 
 
473 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.31 
 
 
473 aa  350  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.31 
 
 
473 aa  350  4e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.31 
 
 
473 aa  350  4e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.31 
 
 
473 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.31 
 
 
473 aa  350  4e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.31 
 
 
473 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.65 
 
 
465 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.09 
 
 
471 aa  347  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.24 
 
 
463 aa  347  4e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>