More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1756 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  100 
 
 		 516 aa  1014    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  67.71 
 
 		 458 aa  606  9.999999999999999e-173  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  44 
 
 		 484 aa  359  5e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  38.12 
 
 		 471 aa  304  3.0000000000000004e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  38.64 
 
 		 474 aa  296  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  39.42 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  40.13 
 
 		 480 aa  294  3e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  40.36 
 
 		 477 aa  292  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  39.61 
 
 		 476 aa  289  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  40.5 
 
 		 463 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  40.27 
 
 		 463 aa  287  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  37.99 
 
 		 459 aa  287  4e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  37.89 
 
 		 468 aa  283  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  38.48 
 
 		 466 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  36.63 
 
 		 478 aa  277  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  40.49 
 
 		 448 aa  276  8e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  39.64 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  34.22 
 
 		 507 aa  269  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  38.98 
 
 		 447 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  37.28 
 
 		 465 aa  267  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  36.36 
 
 		 464 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  36.36 
 
 		 464 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  36.36 
 
 		 464 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  36.36 
 
 		 464 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  36.36 
 
 		 464 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  38.99 
 
 		 468 aa  261  3e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  35.38 
 
 		 492 aa  260  4e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  36.36 
 
 		 464 aa  259  6e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  36.36 
 
 		 464 aa  259  6e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  36.36 
 
 		 464 aa  259  6e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  36.36 
 
 		 464 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  36.36 
 
 		 464 aa  259  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  36.36 
 
 		 464 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  36.36 
 
 		 464 aa  259  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  37.5 
 
 		 468 aa  259  7e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  36.14 
 
 		 464 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  36.36 
 
 		 464 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  35.88 
 
 		 468 aa  256  5e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  37.74 
 
 		 472 aa  256  7e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  36.26 
 
 		 480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  38.21 
 
 		 486 aa  254  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  36.32 
 
 		 480 aa  253  6e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  36.61 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  35.65 
 
 		 499 aa  252  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  37.58 
 
 		 438 aa  252  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  35.23 
 
 		 468 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  33.26 
 
 		 480 aa  251  2e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  35.91 
 
 		 482 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  37.13 
 
 		 457 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  36.72 
 
 		 480 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  37.64 
 
 		 533 aa  250  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  34.84 
 
 		 480 aa  249  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  37.81 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  35.76 
 
 		 457 aa  246  8e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  35.14 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  36.94 
 
 		 464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  37.07 
 
 		 497 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  38.53 
 
 		 474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  35.04 
 
 		 450 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  36.16 
 
 		 491 aa  243  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  35.42 
 
 		 442 aa  243  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  38.1 
 
 		 485 aa  243  7.999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  37.5 
 
 		 474 aa  243  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  36.16 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  36.16 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  36.16 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  36.16 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  36.16 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  36.16 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  36.32 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  36.32 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  36.32 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  36.32 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  33.19 
 
 		 466 aa  241  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  36.32 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  36.32 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  36.32 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  35.43 
 
 		 485 aa  240  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  33.97 
 
 		 475 aa  240  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  36.14 
 
 		 491 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  38.31 
 
 		 493 aa  239  5.999999999999999e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  36.11 
 
 		 472 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  34.67 
 
 		 473 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  36.11 
 
 		 472 aa  239  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  37.19 
 
 		 491 aa  238  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  34.79 
 
 		 544 aa  238  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  38.6 
 
 		 473 aa  238  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  38.37 
 
 		 473 aa  236  8e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  35.15 
 
 		 472 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  34.51 
 
 		 480 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  36.34 
 
 		 452 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  36.34 
 
 		 452 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  33.85 
 
 		 477 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  35.67 
 
 		 472 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  35.67 
 
 		 472 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  35.67 
 
 		 472 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  35.67 
 
 		 472 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  33.62 
 
 		 473 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  35.09 
 
 		 471 aa  233  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  32.78 
 
 		 471 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>