More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0658 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0658  permease of the major facilitator superfamily  100 
 
 		 485 aa  959    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.590518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 415 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  32.35 
 
 		 397 aa  217  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  32.12 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 		 439 aa  211  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 412 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 439 aa  140  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  28.35 
 
 		 411 aa  134  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 407 aa  123  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  25.18 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  28.01 
 
 		 405 aa  114  5e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 425 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  26.19 
 
 		 450 aa  107  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 425 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  27.42 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  24.64 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  23.75 
 
 		 422 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  23.75 
 
 		 422 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  23.4 
 
 		 414 aa  100  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  24.19 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.75 
 
 		 422 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  23.49 
 
 		 422 aa  99  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  23.75 
 
 		 422 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.28 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  23.99 
 
 		 422 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0969  major facilitator superfamily permease  21.6 
 
 		 410 aa  95.5  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00309098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  25 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  25 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  21.18 
 
 		 1833 aa  94.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 439 aa  92.8  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  23.99 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 445 aa  88.2  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 434 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 		 444 aa  87.4  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 434 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.62 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.49 
 
 		 1876 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  21.71 
 
 		 418 aa  79.7  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 438 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 419 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  24.44 
 
 		 1769 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  22.68 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  19.71 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  23.08 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  22.8 
 
 		 1829 aa  77  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  21.83 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  22.1 
 
 		 1816 aa  73.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  21.85 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  21.53 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  31.13 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  24.36 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  20.13 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  21.55 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  24.6 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  24.35 
 
 		 1776 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  21.43 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0384  major facilitator superfamily permease  22.72 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0918  major facilitator superfamily permease  23.21 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  22.88 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  26.18 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  30.37 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  23.52 
 
 		 1839 aa  63.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  23.8 
 
 		 1864 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  22.58 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  21.31 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  23.5 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  25.31 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 524 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  21.31 
 
 		 415 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  21.07 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  21.04 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  26.85 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  24.23 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>