40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0197 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0197  endo-beta-N-acetylglucosaminidase D  100 
 
 		 927 aa  1891    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1714  glycoside hydrolase family protein  47.49 
 
 		 951 aa  821    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  48.08 
 
 		 1135 aa  879    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0280  glycosy hydrolase family protein  47.55 
 
 		 740 aa  677    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1016  glycoside hydrolase family protein  40.23 
 
 		 880 aa  624  1e-177  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4999  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  32.21 
 
 		 834 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.517089  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1083  glycoside hydrolase family protein  36.6 
 
 		 807 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148049 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0815  glycosy hydrolase family protein  33.76 
 
 		 1127 aa  396  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1190  glycoside hydrolase family protein  36.79 
 
 		 807 aa  396  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112997  normal  0.725074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0126  glycoside hydrolase family protein  28.45 
 
 		 586 aa  222  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0534718  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0300  glycoside hydrolase family protein  28.97 
 
 		 592 aa  198  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0279  surface layer protein B  49.51 
 
 		 108 aa  95.5  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  35.77 
 
 		 899 aa  81.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1713  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.29 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  34.46 
 
 		 1164 aa  75.5  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0803  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.51 
 
 		 712 aa  60.5  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.969227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  31.62 
 
 		 1070 aa  58.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  30.97 
 
 		 850 aa  57.4  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.87 
 
 		 1264 aa  57  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  30.65 
 
 		 752 aa  55.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  32.37 
 
 		 571 aa  54.7  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.14 
 
 		 756 aa  53.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.69 
 
 		 953 aa  51.2  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.17 
 
 		 695 aa  51.2  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2888  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.79 
 
 		 356 aa  50.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.057915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  32.74 
 
 		 392 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.45 
 
 		 698 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  36.17 
 
 		 768 aa  49.7  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.19 
 
 		 1158 aa  49.3  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  36.7 
 
 		 850 aa  48.9  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  32.46 
 
 		 1581 aa  48.5  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  29.29 
 
 		 578 aa  48.5  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  31.3 
 
 		 644 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  27.22 
 
 		 591 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.34 
 
 		 471 aa  47  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.36 
 
 		 674 aa  45.8  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.41 
 
 		 971 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.8 
 
 		 709 aa  45.1  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  30.36 
 
 		 879 aa  44.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.69 
 
 		 704 aa  44.7  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>