More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B0278 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
290 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  94.14 
 
 
290 aa  570  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  92.76 
 
 
290 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  92.41 
 
 
290 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  91.72 
 
 
290 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  92.41 
 
 
290 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  91.72 
 
 
290 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  90.69 
 
 
290 aa  557  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  91.38 
 
 
290 aa  554  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  90 
 
 
290 aa  551  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  66.9 
 
 
292 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  51.9 
 
 
291 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  51.56 
 
 
291 aa  335  7e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  52.07 
 
 
280 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  42.16 
 
 
286 aa  245  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1266  AraC family transcriptional regulator  41.26 
 
 
300 aa  236  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23796  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  43.54 
 
 
281 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  43.73 
 
 
281 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  43.14 
 
 
284 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  39.52 
 
 
287 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  43.54 
 
 
281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  41.81 
 
 
281 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 
287 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  38.68 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 
289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  41.75 
 
 
313 aa  210  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  35.42 
 
 
288 aa  208  8e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 
292 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  38.44 
 
 
281 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  35.17 
 
 
285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2127  transcription activator effector binding protein  38.06 
 
 
290 aa  198  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 
290 aa  195  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 
288 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0137  AraC family transcriptional regulator  45.05 
 
 
315 aa  188  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.10009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 
285 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3344  helix-turn-helix domain-containing protein  40.31 
 
 
232 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.388455  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  33.79 
 
 
282 aa  172  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 
280 aa  168  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  33.56 
 
 
281 aa  156  4e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1798  transcriptional regulator, AraC family  44.59 
 
 
200 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  29.14 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  29.14 
 
 
300 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 
300 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  28.81 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 
300 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0674  AraC family transcriptional regulator  52.1 
 
 
265 aa  132  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0086  transcriptional regulator, AraC family  31.62 
 
 
313 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.353006  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  24 
 
 
302 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1353  transcription activator effector binding  35.8 
 
 
160 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.266351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  25.86 
 
 
279 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 
279 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  25.17 
 
 
279 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  27.46 
 
 
279 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  24.75 
 
 
277 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  26.23 
 
 
298 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  25.61 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1069  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.689445  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  24.08 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  23.97 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1563  transcription activator, effector binding  22.92 
 
 
297 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1594  transcription activator effector binding  22.92 
 
 
297 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  24.67 
 
 
291 aa  93.2  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 
294 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 
279 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  25.87 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3482  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 
140 aa  87  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119803  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  25.35 
 
 
294 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 
452 aa  86.7  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  25.68 
 
 
284 aa  86.3  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  22.56 
 
 
298 aa  85.9  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  36.44 
 
 
129 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  25.6 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  23.73 
 
 
314 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  22.6 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  24.32 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  24.2 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  31.91 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3219  transcription activator effector binding  31.52 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  31.91 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  31.91 
 
 
288 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  23.31 
 
 
286 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  22.66 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  31.91 
 
 
288 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  21.94 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  25.26 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  22.97 
 
 
289 aa  77  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>