55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6751 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6751  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0919  hypothetical protein  36.12 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3075  putative phage tail collar domain  33.65 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.242473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5767  putative phage tail Collar domain  29.13 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0519  Tail Collar domain protein  41.75 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  33.33 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  28.16 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  33.49 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  34.52 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  33.49 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  30.69 
 
 		 181 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  29.21 
 
 		 178 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  27.62 
 
 		 189 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  27.62 
 
 		 189 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  39.09 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  30.77 
 
 		 175 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  26.92 
 
 		 163 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  28.96 
 
 		 171 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  28.81 
 
 		 176 aa  50.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  35.96 
 
 		 173 aa  50.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  28.89 
 
 		 180 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  49.7  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  30.77 
 
 		 177 aa  49.3  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  30.34 
 
 		 170 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2573  Tail Collar domain protein  41.57 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1951  hypothetical protein  36.99 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  26.52 
 
 		 264 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  44.12 
 
 		 654 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  44.12 
 
 		 654 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  37.5 
 
 		 172 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  35.71 
 
 		 176 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  29.21 
 
 		 181 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  32.71 
 
 		 195 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  25.91 
 
 		 182 aa  46.6  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0240  microcystin-dependent protein-like  29 
 
 		 268 aa  46.2  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1749  Tail Collar domain protein  38.64 
 
 		 261 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  27.86 
 
 		 181 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  31.49 
 
 		 196 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  38.24 
 
 		 204 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  27.8 
 
 		 176 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  33.7 
 
 		 181 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  27.75 
 
 		 182 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  28.09 
 
 		 171 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  42.86 
 
 		 501 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  32.08 
 
 		 174 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  31.78 
 
 		 169 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  27.57 
 
 		 173 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  25.38 
 
 		 206 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  37.65 
 
 		 195 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  33.61 
 
 		 176 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  39.77 
 
 		 210 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  52.73 
 
 		 492 aa  42.7  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  29.93 
 
 		 181 aa  42.7  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  26.82 
 
 		 166 aa  42.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  29.55 
 
 		 177 aa  42.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>