46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0919 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0919  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6751  hypothetical protein  36.53 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  29.19 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  29.76 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  29.71 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  28.07 
 
 		 175 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  27.33 
 
 		 178 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  28.12 
 
 		 181 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  27.13 
 
 		 176 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  29.07 
 
 		 172 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1951  hypothetical protein  48.28 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  30.23 
 
 		 180 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  25.6 
 
 		 171 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  28.57 
 
 		 166 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  29.38 
 
 		 182 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  36.08 
 
 		 195 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  30.06 
 
 		 174 aa  50.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  29.89 
 
 		 199 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  25.15 
 
 		 173 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5767  putative phage tail Collar domain  29.76 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  29.03 
 
 		 176 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  29.32 
 
 		 199 aa  47.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  24.86 
 
 		 192 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  25.71 
 
 		 169 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  31.36 
 
 		 181 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  32.23 
 
 		 181 aa  46.6  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  30.29 
 
 		 169 aa  46.2  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  26.97 
 
 		 177 aa  45.8  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  30.37 
 
 		 199 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  28.65 
 
 		 182 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  26.56 
 
 		 178 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  27.33 
 
 		 172 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  26.94 
 
 		 180 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  29.07 
 
 		 165 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  26.7 
 
 		 171 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  28.82 
 
 		 176 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  35.23 
 
 		 176 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  29.84 
 
 		 199 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  26.47 
 
 		 171 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  29.84 
 
 		 199 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  34.09 
 
 		 207 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1749  Tail Collar domain protein  29.77 
 
 		 261 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0240  microcystin-dependent protein-like  29.74 
 
 		 268 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  29.65 
 
 		 181 aa  42.7  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  26.75 
 
 		 179 aa  42.7  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  28.07 
 
 		 183 aa  42.4  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>