More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5187 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5187  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  180  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3251  hypothetical protein  80.46 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1654  hypothetical protein  79.07 
 
 		 114 aa  150  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.341488  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3875  hypothetical protein  80.23 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3117  hypothetical protein  83.33 
 
 		 109 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2181  hypothetical protein  77.91 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.209372  normal  0.016777 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1326  hypothetical protein  72.62 
 
 		 117 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7170  protein of unknown function DUF37  61.45 
 
 		 111 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536333  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2267  hypothetical protein  57.65 
 
 		 106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.412253 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2542  protein of unknown function DUF37  56.47 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6322  hypothetical protein  60.24 
 
 		 101 aa  107  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29696  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2224  protein of unknown function DUF37  55.29 
 
 		 105 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0489467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4641  hypothetical protein  58.54 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1039  hypothetical protein  55.7 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0811786  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1073  hypothetical protein  55.7 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2156  hypothetical protein  54.43 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1051  hypothetical protein  54.55 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2047  hypothetical protein  53.25 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1847  hypothetical protein  53.25 
 
 		 134 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108627  normal  0.0267383 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1573  hypothetical protein  47.56 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0922315  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1006  hypothetical protein  54.79 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1652  hypothetical protein  47.67 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  50.62 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2209  hypothetical protein  50.67 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.304599  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0642  hypothetical protein  45.57 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.485959  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  53.23 
 
 		 78 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  50.82 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  51.61 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  53.45 
 
 		 73 aa  71.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  46.88 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  51.52 
 
 		 84 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  47.54 
 
 		 81 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  43.75 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  47.54 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2394  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  51.61 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  45.31 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  45.16 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  53.23 
 
 		 80 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  47.06 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  48.39 
 
 		 81 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  47.54 
 
 		 73 aa  67  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  51.52 
 
 		 81 aa  67  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  47.06 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  48.48 
 
 		 86 aa  67  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  43.75 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  45.9 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  49.18 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4526  hypothetical protein  46.88 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0565239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6076  hypothetical protein  51.61 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0967401  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  49.18 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  49.18 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  46.77 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0033  conserved hypothetical protein TIGR00278  46.55 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.97482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  47.54 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  45.9 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0034  protein of unknown function DUF37  46.55 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.908916  normal  0.29812 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  45.31 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  43.84 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  48.39 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  43.55 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  43.84 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  46.77 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5787  hypothetical protein  48 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.702755  normal  0.0165657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5411  hypothetical protein  48 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  45.59 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0006  hypothetical protein  48 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814058  normal  0.0634451 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1745  hypothetical protein  42.19 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  45.16 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  47.76 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  42.19 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  46.88 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0135  hypothetical protein  44.62 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0388939  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  42.86 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04611  hypothetical protein  46.77 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  44.78 
 
 		 80 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  45.83 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  43.84 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  47.62 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  43.55 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  43.48 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  43.55 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  44.07 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  46.03 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  44.62 
 
 		 75 aa  63.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  45.9 
 
 		 81 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4222  hypothetical protein  50.91 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0406  hypothetical protein  46.77 
 
 		 63 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  39.06 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  48.39 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  41.67 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  39.71 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  45.16 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  46.77 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  46.77 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  45.16 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  39.71 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>