More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4899 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  100 
 
 
269 aa  547  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  60.22 
 
 
270 aa  317  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  57.84 
 
 
269 aa  316  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  56.77 
 
 
272 aa  287  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  58.87 
 
 
272 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  58.87 
 
 
272 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  56.82 
 
 
272 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  53.18 
 
 
279 aa  275  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4063  methyltransferase type 11  52.99 
 
 
271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  54.68 
 
 
272 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1392  Methyltransferase type 11  45.77 
 
 
280 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  42.06 
 
 
526 aa  186  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1935  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.9 
 
 
192 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 
275 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  36.25 
 
 
240 aa  93.2  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  30.81 
 
 
285 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  32.31 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
282 aa  89  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  31.55 
 
 
287 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  31.35 
 
 
274 aa  87  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  30.4 
 
 
581 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  29.26 
 
 
282 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2018  MCP methyltransferase, CheR-type  31.79 
 
 
865 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.854917  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2080  MCP methyltransferase, CheR-type  42.34 
 
 
825 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.646014  normal  0.992336 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.98 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.98 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  33.13 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  29.25 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  33.68 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.65 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  34.39 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  29.48 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.9 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  29.95 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  37.93 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  36.48 
 
 
281 aa  79  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.44 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  45.1 
 
 
212 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.73 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  27.13 
 
 
325 aa  77  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4511  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  34.07 
 
 
250 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.96 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.12 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  40.69 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.59 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.74 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  33.57 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  31.49 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  31.91 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  32.1 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  37.96 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.512948  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.59 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  31.85 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  37.41 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  30.17 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0069  demethylmenaquinone methyltransferase  30.73 
 
 
258 aa  72  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  34.05 
 
 
270 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  39.83 
 
 
277 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  46.15 
 
 
524 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.05 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  37.69 
 
 
270 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.51 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2670  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  44.66 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  31.38 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  31.38 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.2 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  30.6 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2016  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.72 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  27.52 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  28.05 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0503  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.99 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0393  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  37.62 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2700  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  35.51 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.49 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  27.48 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4023  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.74 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3368  2-polyprenylmethoxybenozoquinol methylase  31.11 
 
 
250 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.6 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  31.72 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6252  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.89 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.6 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.83 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  40.94 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.64 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  30.81 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3495  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.05 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0172261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  27.51 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  28.29 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  28 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.18 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.32 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  35.85 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>