More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3986 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3986  putative ABC transporter (permease protein)  100 
 
 
313 aa  627  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.03 
 
 
312 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.54 
 
 
312 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.746865  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2949  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.13 
 
 
302 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.69 
 
 
315 aa  295  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.73 
 
 
309 aa  237  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.43514  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  41.4 
 
 
310 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  43.17 
 
 
354 aa  216  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 
345 aa  212  7e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000672298  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 
330 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.59 
 
 
332 aa  207  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.49 
 
 
294 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000181172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
338 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
338 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.335951  normal  0.466485 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
300 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0038089  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
291 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1875  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  35.76 
 
 
350 aa  183  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0432685  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
294 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180469  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2010  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  35.63 
 
 
318 aa  179  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360583  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
296 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2651  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
294 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493427  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.454536  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2755  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
333 aa  172  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.276283  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
309 aa  172  9e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.179346  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
317 aa  172  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
314 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748515 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
299 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
299 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
314 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
319 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  hitchhiker  0.000205378 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
313 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.99 
 
 
325 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
295 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
293 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259426  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5738  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.08 
 
 
302 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  34.78 
 
 
305 aa  166  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
309 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6025  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
305 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
313 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.142654 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
305 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1247  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
308 aa  162  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.732084 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
296 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  34.7 
 
 
321 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
317 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 
307 aa  159  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  31.49 
 
 
307 aa  159  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
305 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.825826  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
305 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
317 aa  159  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
312 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
306 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
312 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
316 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  36.03 
 
 
287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
309 aa  155  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
298 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
295 aa  154  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
275 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1183  ABC transporter, permease protein  32.96 
 
 
307 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0557  ABC transporter, permease protein  30.28 
 
 
308 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2817  putative carbohydrate ABC transporter, permease protein  32.96 
 
 
307 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0541  ABC transporter, permease protein  30.28 
 
 
308 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
313 aa  152  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194798  decreased coverage  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
305 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
319 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
305 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.980812  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3837  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
350 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344745  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
305 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
318 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
322 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 
289 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
313 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00226923  hitchhiker  0.00373728 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.29 
 
 
289 aa  148  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.29 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  32.22 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3909  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0295  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  33.94 
 
 
300 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
313 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2715  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  31.17 
 
 
350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392142  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.10809  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01490  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.09 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.659857  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
308 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.283214  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7706  sugar ABC transporter permease protein  31.47 
 
 
303 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
307 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1304  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  30.72 
 
 
334 aa  145  6e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00913134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0497455  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
306 aa  145  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
340 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00310659  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
302 aa  145  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>