225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3707 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3707  L-lysine 2,3-aminomutase  100 
 
 		 460 aa  934    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1185  L-lysine 2,3-aminomutase  50.82 
 
 		 456 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  0.0471893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0373  radical SAM domain-containing protein  50.12 
 
 		 468 aa  459  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4391  L-lysine 2,3-aminomutase  47.15 
 
 		 445 aa  449  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3329  radical SAM domain-containing protein  48.43 
 
 		 454 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0522321  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1721  radical SAM domain-containing protein  48.13 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00272904  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0744  hypothetical protein  52.9 
 
 		 442 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.161116  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3480  hypothetical protein  49.42 
 
 		 484 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41820  Lysine 2,3-aminomutase  46.54 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0272  L-lysine 2,3-aminomutase  48.59 
 
 		 453 aa  432  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218076  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1163  radical SAM domain protein  45.82 
 
 		 433 aa  428  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.587423 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1404  radical SAM domain protein  45.87 
 
 		 434 aa  428  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1772  lysine 2,3-aminomutase related protein  44.58 
 
 		 448 aa  425  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0857  hypothetical protein  49.17 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6159  radical SAM domain-containing protein  46.92 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4495  hypothetical protein  49.05 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.0100424 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0186  L-lysine 2,3-aminomutase  43.54 
 
 		 441 aa  420  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.298559  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4154  hypothetical protein  47.75 
 
 		 454 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8940  L-lysine 2,3-aminomutase  48.09 
 
 		 461 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34965  predicted protein  47 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2692  L-lysine 2,3-aminomutase  49.16 
 
 		 450 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2058  radical SAM family protein  45.82 
 
 		 480 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
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NC_009380  Strop_2771  hypothetical protein  46.51 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250775 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5255  L-lysine 2,3-aminomutase  46.68 
 
 		 441 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0616  L-lysine 2,3-aminomutase  42.41 
 
 		 485 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3603  hypothetical protein  28.33 
 
 		 555 aa  192  9e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.610443  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0169  lysine 2,3-aminomutase  29.17 
 
 		 370 aa  180  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3711  hypothetical protein  28.04 
 
 		 493 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009616  Tmel_1010  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.22 
 
 		 370 aa  178  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0471384  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_0826  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.55 
 
 		 365 aa  167  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0343  L-lysine 2,3-aminomutase  31.04 
 
 		 368 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0150832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0803  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.28 
 
 		 365 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2387  hypothetical protein  31.06 
 
 		 376 aa  163  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000550657  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_1757  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.96 
 
 		 379 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0135  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.13 
 
 		 392 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.423107  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1790  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.03 
 
 		 386 aa  154  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  38.22 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007519  Dde_2747  L-lysine 2,3-aminomutase  31.05 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.88 
 
 		 396 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  34.82 
 
 		 457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.9 
 
 		 440 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
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NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.43 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.35 
 
 		 374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.33 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.566148 
 
 
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NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  29.88 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  29.66 
 
 		 453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
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NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.22 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  36.68 
 
 		 364 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.19 
 
 		 437 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  31.91 
 
 		 454 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  32.77 
 
 		 730 aa  109  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.8 
 
 		 393 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.08 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.27 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.61 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
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NC_007908  Rfer_3891  hypothetical protein  30.55 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.33 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  34.83 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.19 
 
 		 440 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5091  hypothetical protein  30.77 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.25 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5769  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.77 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0255046 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.78 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  29.58 
 
 		 730 aa  107  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.56 
 
 		 362 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.13 
 
 		 427 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007984  BCI_0590  YodO family protein  29.82 
 
 		 339 aa  107  5e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  34.33 
 
 		 324 aa  107  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  32.14 
 
 		 360 aa  107  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  29.23 
 
 		 708 aa  106  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  31.1 
 
 		 349 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.54 
 
 		 351 aa  106  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.33 
 
 		 433 aa  106  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.5 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
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NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.68 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  30.61 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.68 
 
 		 345 aa  104  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  24.5 
 
 		 433 aa  104  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.72 
 
 		 350 aa  104  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  33.04 
 
 		 527 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.77 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.94 
 
 		 340 aa  103  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.91 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  35.29 
 
 		 353 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.87 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.79 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0947  L-lysine 2,3-aminomutase  29.66 
 
 		 305 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167419  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4603  KamA family protein  33.75 
 
 		 342 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.639324  normal  0.81318 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4703  KamA family protein  31.65 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3866  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.65 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.358809 
 
 
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NC_009800  EcHS_A4388  KamA family protein  31.65 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  29.5 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  30.11 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  30.21 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
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NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.54 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
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NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.32 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007969  Pcryo_1949  hypothetical protein  29.89 
 
 		 335 aa  100  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.667816  normal  1 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  30.9 
 
 		 334 aa  100  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.9 
 
 		 334 aa  100  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.8 
 
 		 422 aa  100  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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