191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3547 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3547  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1271  peptidase M50  69.51 
 
 		 227 aa  274  7e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194788  normal  0.0570245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1519  peptidase M50  70.85 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3737  peptidase M50  61.19 
 
 		 224 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3219  peptidase M50  59.82 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2248  peptidase M50  58.9 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  53.96 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  47.51 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1788  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  52.78 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1465  peptidase M50  52.78 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.658602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  44.29 
 
 		 227 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  45.86 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  45.86 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  49.44 
 
 		 220 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  49.44 
 
 		 220 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  49.44 
 
 		 220 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  46.41 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  48.92 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  48.88 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  49.72 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  49.47 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  49.44 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  48.89 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  48.92 
 
 		 221 aa  154  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  45.93 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  48.88 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  48.88 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  45.93 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  45.93 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  45.93 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  45.93 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  45.93 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0681  peptidase M50  48.66 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.259408  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  48.97 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  44.62 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  47.8 
 
 		 222 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  45.95 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  48.13 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  46.11 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3239  peptidase M50  46.7 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  47.31 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  48.92 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  48.33 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  49.44 
 
 		 218 aa  147  9e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  46.7 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  45.99 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1686  peptidase M50  42.62 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156673  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1339  peptidase M50  45.88 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000024793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  48.35 
 
 		 220 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1002  peptidase M50  45.16 
 
 		 222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693021  hitchhiker  0.000264691 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  45.26 
 
 		 221 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  44.74 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2756  peptidase M50  43.16 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  47.4 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1582  peptidase M50  47.25 
 
 		 220 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453611  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  47.31 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2551  peptidase M50  46.7 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00369558  normal  0.148044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  46.77 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0952  peptidase M50  45.89 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1526  putative integral membrane transmembrane protein  50.26 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0750535 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  41.99 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  45.41 
 
 		 247 aa  138  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1624  peptidase M50  44.51 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  44.02 
 
 		 230 aa  135  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  42.86 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  44.02 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1875  peptidase M50  45.76 
 
 		 213 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  37.37 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  41.26 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  36.41 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2316  peptidase M50  47.34 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1225  peptidase M50  39.46 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.460426  normal  0.363921 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1142  integral membrane transmembrane protein  41.94 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1686  peptidase M50  47.2 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  45.59 
 
 		 207 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2170  peptidase M50  47.2 
 
 		 222 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1037  peptidase M50  42.46 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.489327  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  43.6 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0843  peptidase M50  41.71 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09610  Zn-dependent protease  39.06 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000371518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0801  peptidase M50  40.95 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06780  Zn-dependent protease  41.27 
 
 		 228 aa  124  9e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0109989  normal  0.843659 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1419  peptidase M50  45.03 
 
 		 207 aa  124  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0643259  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  41.81 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0720  peptidase M50  43.39 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.089532  normal  0.0115297 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  40.86 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  40.86 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  40.32 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  40.86 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  40.86 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  38.59 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  40.32 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  40.32 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  40.32 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1132  peptidase M50  39.53 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2118  peptidase M50  45.6 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  0.0277239 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  40.66 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  39.25 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  39.78 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3670  peptidase M50  41.85 
 
 		 256 aa  118  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>