41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2204 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  813    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  54.75 
 
 		 390 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  25.23 
 
 		 473 aa  133  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  25.23 
 
 		 473 aa  133  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3336  hypothetical protein  31.96 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  26.78 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  27.76 
 
 		 480 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  26.61 
 
 		 463 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  24.04 
 
 		 440 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2843  hypothetical protein  26.25 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3920  hypothetical protein  29.24 
 
 		 418 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186757  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  29.46 
 
 		 418 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  28.69 
 
 		 427 aa  90.1  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0137  hypothetical protein  30.17 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2684  hypothetical protein  28.85 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5128  hypothetical protein  26.74 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3796  hypothetical protein  31.61 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  26.83 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0220  hypothetical protein  23.39 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  37.3 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  37.41 
 
 		 479 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  32.56 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  24.39 
 
 		 462 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  32.33 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1912  hypothetical protein  24.53 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0782839  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  35.25 
 
 		 435 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  29.37 
 
 		 456 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  29.01 
 
 		 437 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  28.67 
 
 		 483 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4419  hypothetical protein  28.03 
 
 		 303 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  29.29 
 
 		 453 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  27.56 
 
 		 605 aa  50.1  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  34.48 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  36.36 
 
 		 602 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  25 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2344  hypothetical protein  33.85 
 
 		 625 aa  47.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  29.29 
 
 		 464 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  40.45 
 
 		 477 aa  43.9  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  27.92 
 
 		 443 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  37.5 
 
 		 511 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  35.38 
 
 		 562 aa  42.7  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>