53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2071 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2071  hypothetical protein  100 
 
 		 493 aa  959    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.555824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1306  fusaric acid resistance protein region  41.55 
 
 		 644 aa  323  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.389506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5715  fusaric acid resistance protein region  37.03 
 
 		 661 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  30.25 
 
 		 635 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.21 
 
 		 641 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2360  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.54 
 
 		 639 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5952  membrane protein  29.64 
 
 		 623 aa  99  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0233  membrane protein-like  27.25 
 
 		 653 aa  84.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  29.57 
 
 		 700 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  23.65 
 
 		 702 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.28 
 
 		 697 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  26.96 
 
 		 726 aa  60.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5223  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.24 
 
 		 678 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0716017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4155  hypothetical protein  26.11 
 
 		 672 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0306653  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4756  fusaric acid resistance protein region  27.24 
 
 		 678 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5298  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.59 
 
 		 678 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.812245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  26.48 
 
 		 673 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  26.48 
 
 		 673 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  26.48 
 
 		 673 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  29.03 
 
 		 676 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  29.07 
 
 		 662 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  27.27 
 
 		 679 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.18 
 
 		 722 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.61 
 
 		 653 aa  55.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  25.73 
 
 		 728 aa  54.3  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  27.91 
 
 		 662 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2051  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.45 
 
 		 752 aa  53.9  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  23.31 
 
 		 676 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  29.07 
 
 		 662 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  25.12 
 
 		 699 aa  52  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  23.78 
 
 		 676 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  27.06 
 
 		 676 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  23.48 
 
 		 704 aa  50.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  23.78 
 
 		 744 aa  50.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  25.27 
 
 		 698 aa  47.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  25.83 
 
 		 662 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  29.15 
 
 		 711 aa  47  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  23.33 
 
 		 736 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  22.88 
 
 		 726 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  23.91 
 
 		 714 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  25.82 
 
 		 679 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  25.82 
 
 		 679 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3739  fusaric acid resistance protein region  22.88 
 
 		 726 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.42 
 
 		 688 aa  45.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  26.32 
 
 		 727 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48340  hypothetical protein  28.93 
 
 		 679 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00973423  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.05 
 
 		 739 aa  44.3  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3667  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  27.9 
 
 		 651 aa  44.3  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0273  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  27.96 
 
 		 662 aa  43.9  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.489457  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  22.88 
 
 		 727 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  22.88 
 
 		 727 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.61 
 
 		 699 aa  43.5  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  22.88 
 
 		 727 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>