50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1523 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1523  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2685  TadE family protein  61.19 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2342  TadE family protein  38.71 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  29.51 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  25.69 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  27.68 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  39.39 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  39.62 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  41.82 
 
 		 177 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  30.53 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  38.98 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  42.31 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  38.98 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  38.98 
 
 		 177 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  33.33 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2498  TadE-like  42.86 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0777596  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  40 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1520  TadE-like  38.33 
 
 		 209 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  27.68 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  40.82 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  27.12 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1061  TadE family protein  32.14 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  33.33 
 
 		 722 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002647  hypothetical protein  27.48 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  36.73 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  36.84 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  30.1 
 
 		 142 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  30.1 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  36.36 
 
 		 177 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  35.59 
 
 		 177 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  40.68 
 
 		 134 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  36.96 
 
 		 157 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  40.82 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  31.48 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4700  TadE family protein  29.82 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  38.89 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3787  TadE family protein  35.59 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3200  TadE family protein  32.73 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.798849 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  32.08 
 
 		 423 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1688  TadE family protein  37.25 
 
 		 175 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.598074  hitchhiker  0.000000154995 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  34.62 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  38.18 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  29.59 
 
 		 138 aa  40  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  26.09 
 
 		 142 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  26.09 
 
 		 142 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  37.5 
 
 		 163 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  27.83 
 
 		 142 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  27.83 
 
 		 142 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  27.83 
 
 		 142 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  27.83 
 
 		 142 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>