98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01372 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  100 
 
 		 867 bp  1719    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  99.65 
 
 		 867 bp  1695    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1773    99.54 
 
 		 868 bp  1681    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627034  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  99.65 
 
 		 867 bp  1695    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  99.77 
 
 		 867 bp  1703    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  100 
 
 		 867 bp  1719    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1145    99.88 
 
 		 867 bp  1711    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  100 
 
 		 867 bp  1719    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0082    99.65 
 
 		 868 bp  1689    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0254232  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0079    99.65 
 
 		 868 bp  1689    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  99.77 
 
 		 867 bp  1703    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0074    98.27 
 
 		 868 bp  1594    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  99.77 
 
 		 867 bp  1703    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2260    99.87 
 
 		 834 bp  1526    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  100 
 
 		 816 bp  1618    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  100 
 
 		 867 bp  1719    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01372    100 
 
 		 1163 bp  2305    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282168  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  100 
 
 		 867 bp  1719    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  100 
 
 		 867 bp  1719    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  99.88 
 
 		 867 bp  1711    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  99.89 
 
 		 897 bp  1770    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  99.88 
 
 		 807 bp  1592    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  100 
 
 		 867 bp  1719    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02658    99.83 
 
 		 1163 bp  2290    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.404747  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  100 
 
 		 867 bp  1719    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  100 
 
 		 867 bp  1719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0198    90.24 
 
 		 641 bp  763    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  100 
 
 		 867 bp  1719    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0042  ISEc17, transposase orfB  95.33 
 
 		 585 bp  898    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3745  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 300 bp  595  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2569  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 300 bp  595  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.078573 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01036  hypothetical protein  100 
 
 		 309 bp  595  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01029  putative transposase-related protein  100 
 
 		 309 bp  595  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3236  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 300 bp  595  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1772  IS3, transposase orfA  100 
 
 		 300 bp  595  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3305  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 300 bp  595  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.130076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2615  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 300 bp  595  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0374663  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1147  IS3, transposase orfA  100 
 
 		 300 bp  595  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1146  IS3, transposase orfA  100 
 
 		 300 bp  595  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0273368  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2507  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 300 bp  595  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.419774  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1570  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 300 bp  595  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.256983  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01359  putative transposase-related protein  100 
 
 		 309 bp  595  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01524  putative transposase-related protein  100 
 
 		 309 bp  595  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4846  IS3, transposase orfA  99.67 
 
 		 300 bp  587  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02695  putative transposase-related protein  99.67 
 
 		 309 bp  587  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0078  IS3, transposase orfA  99.67 
 
 		 300 bp  587  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.598745  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0083  IS3, transposase orfA  99.67 
 
 		 300 bp  587  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.013235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3717  transposase IS3/IS911 family protein  99.33 
 
 		 300 bp  579  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0728  transposase IS3/IS911 family protein  99.33 
 
 		 300 bp  579  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3024  IS3, transposase orfA  99.33 
 
 		 300 bp  579  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.433294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01519    100 
 
 		 267 bp  529  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1228    85.15 
 
 		 854 bp  488  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  81.86 
 
 		 867 bp  375  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0059    93.36 
 
 		 265 bp  367  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  82.29 
 
 		 624 bp  359  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1118  ISEc16, orfB  81.42 
 
 		 867 bp  351  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3159    85.65 
 
 		 432 bp  349  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0074    90.55 
 
 		 399 bp  313  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376988 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0417    83.71 
 
 		 471 bp  305  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00057901 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0365    81.65 
 
 		 561 bp  293  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4202    86.8 
 
 		 825 bp  283  6e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0214    91.26 
 
 		 564 bp  256  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1240    88.11 
 
 		 333 bp  254  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.268129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0213    90.69 
 
 		 250 bp  246  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0357  IS3 transposase OrfA  84.39 
 
 		 300 bp  208  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0073    92.36 
 
 		 299 bp  208  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2944  IS3, transposase orfA  84.39 
 
 		 300 bp  208  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.3441799999999996e-27 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0306  IS3 family element, transposase orfB  91.5 
 
 		 153 bp  200  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0261857  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1238  IS3 OrfA  83.72 
 
 		 300 bp  192  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4878    85.23 
 
 		 534 bp  184  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461894 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4877    85.65 
 
 		 216 bp  182  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.672818  hitchhiker  0.00547052 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1117  IS3 OrfA  83.06 
 
 		 300 bp  176  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4579    85.88 
 
 		 216 bp  153  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3156  ISEc16 transposase orfA  86.34 
 
 		 300 bp  145  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.489208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1239    82.55 
 
 		 540 bp  141  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4664    84.75 
 
 		 216 bp  137  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.200653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4201  transposase IS3/IS911 family protein  86.18 
 
 		 297 bp  131  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1227  transposase IS3/IS911 family protein  80.33 
 
 		 300 bp  127  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3157    84.42 
 
 		 468 bp  115  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.749394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0356  transposase  81.12 
 
 		 528 bp  113  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4298  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  87.95 
 
 		 171 bp  85.7  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4663    86.52 
 
 		 207 bp  81.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4578    86.52 
 
 		 207 bp  81.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4705    94.12 
 
 		 132 bp  77.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3141  hypothetical protein  83.78 
 
 		 240 bp  77.8  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1229    93.75 
 
 		 57 bp  71.9  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0036  transposase family  88.16 
 
 		 1233 bp  71.9  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2377    86.36 
 
 		 256 bp  60  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  88.68 
 
 		 861 bp  58  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  88.68 
 
 		 861 bp  58  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36460  Integrase, catalytic domain-containing protein  88.68 
 
 		 603 bp  58  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  88.68 
 
 		 861 bp  58  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  88.68 
 
 		 861 bp  58  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  88.68 
 
 		 861 bp  58  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1151    89.58 
 
 		 48 bp  56  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1458  hypothetical protein  82.11 
 
 		 150 bp  54  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0060  integrase catalytic subunit  91.89 
 
 		 543 bp  50.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0423    87.5 
 
 		 236 bp  48.1  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>