29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2377 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2377    100 
 
 		 256 bp  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1773    86.36 
 
 		 868 bp  60  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627034  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02658    86.36 
 
 		 1163 bp  60  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.404747  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  86.36 
 
 		 897 bp  60  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01372    86.36 
 
 		 1163 bp  60  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282168  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  86.36 
 
 		 867 bp  60  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  86.36 
 
 		 867 bp  60  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2260    86.36 
 
 		 834 bp  60  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  86.36 
 
 		 867 bp  60  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  86.36 
 
 		 867 bp  60  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  86.36 
 
 		 867 bp  60  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  86.36 
 
 		 867 bp  60  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  86.36 
 
 		 867 bp  60  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  86.36 
 
 		 867 bp  60  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  86.36 
 
 		 816 bp  60  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  86.36 
 
 		 867 bp  60  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1145    86.36 
 
 		 867 bp  60  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0082    86.36 
 
 		 868 bp  60  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0254232  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0079    86.36 
 
 		 868 bp  60  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0074    86.36 
 
 		 868 bp  60  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  86.36 
 
 		 867 bp  60  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  86.36 
 
 		 867 bp  60  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  86.36 
 
 		 867 bp  60  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  86.36 
 
 		 867 bp  60  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  86.36 
 
 		 867 bp  60  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  86.36 
 
 		 807 bp  60  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  86.36 
 
 		 867 bp  60  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  86.36 
 
 		 867 bp  60  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0042  ISEc17, transposase orfB  83.33 
 
 		 585 bp  56  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>