80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44520 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_44520  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 305 aa  574  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.541639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1898  extracellular solute-binding protein family 3  46.29 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1134  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.25 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.276726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5170  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  29.82 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2627  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.39 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0539096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21410  ABC transporter, substrate binding protein, family 3  26.96 
 
 		 292 aa  86.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5767  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000244611 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1129  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.55 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5765  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000625971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3166  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3310  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1889  extracellular solute-binding protein family 3  29.41 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5766  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000645831 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0117  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2434  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.11 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1051  extracellular solute-binding protein family 3  21.83 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4005  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 389 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0338  extracellular solute-binding protein family 3  25.45 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000810551  normal  0.021176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0715  extracellular solute-binding protein family 3  25.73 
 
 		 362 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.337122 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  21.34 
 
 		 260 aa  53.1  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1454  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.758875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  22.96 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0246  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  25.6 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5951  extracellular solute-binding protein family 3  24 
 
 		 276 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245803  normal  0.0107841 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5081  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 265 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4094  extracellular solute-binding protein  22.42 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0267267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4884  extracellular solute-binding protein family 3  29.26 
 
 		 266 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2438  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 271 aa  49.3  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  28.08 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  25.77 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5457  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  35.53 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5520  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0222381  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  23.47 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8012  extracellular solute-binding protein family 3  23.87 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0517  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3333  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  28.83 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  27.19 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3247  extracellular solute-binding protein  21.39 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.206502  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  22.39 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7091  extracellular solute-binding protein family 3  23.56 
 
 		 276 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1695  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 411 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0207768  hitchhiker  0.000479364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3461  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 285 aa  46.2  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.564747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3587  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 345 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0949603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3606  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 345 aa  46.2  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020858 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3449  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  20.96 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2946  extracellular solute-binding protein family 3  24.57 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  25.48 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  25.97 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  22.06 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  21.24 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3397  hypothetical protein  24 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167886  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1420  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000217844  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3190  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.61 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3329  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4667  extracellular solute-binding protein family 3  28.26 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0847  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 367 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  28.46 
 
 		 323 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0660  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  20.73 
 
 		 259 aa  43.9  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  25.29 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0120  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 342 aa  43.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  29.1 
 
 		 263 aa  43.1  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 		 277 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  22.52 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  23.43 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  21.49 
 
 		 264 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0357  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 270 aa  42.7  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0691  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 277 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  21.49 
 
 		 264 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  21.49 
 
 		 264 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  21.49 
 
 		 264 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  21.05 
 
 		 264 aa  42.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1168  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 349 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>