107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_30340 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_30340  potassium channel  100 
 
 		 186 aa  363  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.051354  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  61.7 
 
 		 274 aa  235  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  64.74 
 
 		 284 aa  235  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  62.57 
 
 		 273 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  61.05 
 
 		 277 aa  228  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  65.59 
 
 		 283 aa  228  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  64.52 
 
 		 283 aa  226  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  60.53 
 
 		 277 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  61.29 
 
 		 273 aa  224  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  60.64 
 
 		 273 aa  224  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  63.16 
 
 		 274 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  56.28 
 
 		 276 aa  191  4e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  55.74 
 
 		 276 aa  190  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  53.85 
 
 		 276 aa  188  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  52.17 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  45.99 
 
 		 275 aa  184  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  53.23 
 
 		 272 aa  184  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  47.59 
 
 		 277 aa  182  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  48.68 
 
 		 282 aa  181  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  47.62 
 
 		 282 aa  181  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  47.06 
 
 		 279 aa  180  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  45.99 
 
 		 295 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  47.59 
 
 		 290 aa  177  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  47.59 
 
 		 284 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  47.59 
 
 		 284 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  47.59 
 
 		 284 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  47.59 
 
 		 284 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  47.09 
 
 		 292 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  49.46 
 
 		 271 aa  171  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  45.99 
 
 		 289 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  54.1 
 
 		 272 aa  170  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  44.39 
 
 		 289 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  44.39 
 
 		 289 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  44.39 
 
 		 289 aa  167  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  46.81 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  49.73 
 
 		 294 aa  166  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  50.8 
 
 		 306 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  50.27 
 
 		 307 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  47.85 
 
 		 310 aa  164  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  48.15 
 
 		 287 aa  164  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  44.74 
 
 		 272 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  43.32 
 
 		 273 aa  161  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  47.31 
 
 		 305 aa  161  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  47.54 
 
 		 279 aa  158  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  49.73 
 
 		 298 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  40.98 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  38.5 
 
 		 299 aa  155  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  44.92 
 
 		 276 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  48.91 
 
 		 273 aa  151  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  44.21 
 
 		 288 aa  151  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  42.08 
 
 		 276 aa  150  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  46.99 
 
 		 258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  46.99 
 
 		 285 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  48.68 
 
 		 272 aa  141  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  45.36 
 
 		 295 aa  141  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02294  ion transporter  43.85 
 
 		 290 aa  140  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  43.62 
 
 		 303 aa  139  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  43.62 
 
 		 302 aa  139  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  42.93 
 
 		 279 aa  139  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  44.97 
 
 		 297 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  44.44 
 
 		 297 aa  135  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  38.71 
 
 		 277 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  42.93 
 
 		 303 aa  124  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4211  Ion transport protein  40.96 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  35.45 
 
 		 278 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  35.45 
 
 		 278 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  35.45 
 
 		 278 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  35.45 
 
 		 278 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  35.45 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  33.87 
 
 		 289 aa  95.5  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  35.42 
 
 		 288 aa  91.3  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  35.38 
 
 		 282 aa  86.3  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  33.51 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  28 
 
 		 277 aa  70.9  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  34.48 
 
 		 228 aa  67.8  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  27.59 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.22 
 
 		 409 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  30 
 
 		 419 aa  64.3  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  27.57 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44535  predicted protein  27.27 
 
 		 1283 aa  63.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.231791  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  29.89 
 
 		 311 aa  61.2  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  30.59 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  33.11 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  31.49 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.57 
 
 		 408 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  26.13 
 
 		 265 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  29.34 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  28.88 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  28.88 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  26.37 
 
 		 269 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_7186  VIC family transporter: potassium ion channel  31.25 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0156441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  27.66 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  30.73 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  26.26 
 
 		 357 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  26.95 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  28.74 
 
 		 409 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01080  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 554 aa  52.4  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.160096  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  28.07 
 
 		 412 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1582  Ion transport 2 domain-containing protein  27.84 
 
 		 288 aa  52  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  31.86 
 
 		 263 aa  51.6  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>