235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_10570 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_10570  Integral membrane protein TerC family  100 
 
 
334 aa  661    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  71.96 
 
 
327 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  71.34 
 
 
327 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  70.09 
 
 
330 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  72.67 
 
 
327 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33470  Integral membrane protein TerC family  75.16 
 
 
324 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  68.17 
 
 
347 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  68.37 
 
 
346 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  65.74 
 
 
354 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  64.29 
 
 
354 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  64.74 
 
 
354 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  65.43 
 
 
354 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  64.72 
 
 
325 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  64.42 
 
 
325 aa  401  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  65.14 
 
 
327 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  65.14 
 
 
327 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  65.14 
 
 
325 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  63.3 
 
 
328 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  63.61 
 
 
328 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  63.61 
 
 
328 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  63.61 
 
 
328 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  62.39 
 
 
328 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  65.56 
 
 
329 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  61.66 
 
 
325 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  61.37 
 
 
329 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  60.06 
 
 
354 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  61.66 
 
 
330 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  56.8 
 
 
327 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  56.97 
 
 
339 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  56.35 
 
 
328 aa  352  4e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  56.66 
 
 
329 aa  352  5e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  58.15 
 
 
352 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0806  Integral membrane protein TerC  57.45 
 
 
353 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0840  Integral membrane protein TerC  56.88 
 
 
341 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251976  hitchhiker  0.00983722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0880  integral membrane protein TerC  56.88 
 
 
341 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4372  integral membrane protein TerC  57.62 
 
 
341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18139  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2008  integral membrane protein TerC  54.55 
 
 
344 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0222851 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4912  Integral membrane protein TerC  56.23 
 
 
341 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  50.32 
 
 
329 aa  296  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  47.12 
 
 
328 aa  294  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  49.53 
 
 
338 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  46.58 
 
 
320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  48.15 
 
 
331 aa  286  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  50.81 
 
 
325 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  53 
 
 
314 aa  281  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  49.84 
 
 
313 aa  279  5e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  47.87 
 
 
359 aa  275  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  43.83 
 
 
337 aa  275  9e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  49.52 
 
 
334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  44.79 
 
 
317 aa  272  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  46.95 
 
 
328 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  50.16 
 
 
318 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  46.3 
 
 
328 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  45.11 
 
 
317 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  47.02 
 
 
317 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  46.71 
 
 
317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  46.34 
 
 
325 aa  266  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  45.4 
 
 
316 aa  263  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  44.38 
 
 
321 aa  263  4e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  44.44 
 
 
321 aa  262  8e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  44.69 
 
 
321 aa  261  8.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  46.08 
 
 
317 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  46.42 
 
 
322 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  46.67 
 
 
318 aa  256  4e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  48.55 
 
 
344 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  46.11 
 
 
322 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  46.11 
 
 
322 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  46.11 
 
 
322 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  47.15 
 
 
344 aa  255  7e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  46.11 
 
 
337 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  45.29 
 
 
325 aa  255  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  46.98 
 
 
321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  48.42 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  46.98 
 
 
321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  45.79 
 
 
325 aa  253  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  49.03 
 
 
323 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  46.67 
 
 
321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  46.67 
 
 
321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  46.67 
 
 
321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  46.67 
 
 
320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  43.56 
 
 
322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  46.67 
 
 
321 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  46.67 
 
 
321 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  44.01 
 
 
311 aa  252  5.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  46.67 
 
 
321 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  44.37 
 
 
308 aa  252  8.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  44.16 
 
 
334 aa  252  8.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  45.1 
 
 
335 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  48.64 
 
 
320 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  40.06 
 
 
306 aa  250  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  45.96 
 
 
342 aa  249  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  45 
 
 
320 aa  249  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  41.31 
 
 
311 aa  248  9e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  46.28 
 
 
308 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  40.06 
 
 
307 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  44.44 
 
 
325 aa  245  8e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  46.11 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  48.3 
 
 
320 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  40.66 
 
 
310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  48.3 
 
 
320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>