More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7029 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7029  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  100 
 
 		 307 aa  605  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.73 
 
 		 307 aa  440  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.24 
 
 		 305 aa  418  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.24 
 
 		 305 aa  418  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.721041  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4405  alkaline phosphatase  60.59 
 
 		 306 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1582  oligopeptide transporter permease  56.35 
 
 		 306 aa  354  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.733786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1936  oligopeptide transporter permease  56.35 
 
 		 306 aa  354  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1879  oligopeptide transporter permease  56.35 
 
 		 306 aa  355  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675854 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1400  oligopeptide transporter permease  56.35 
 
 		 306 aa  354  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1873  oligopeptide transporter permease  56.35 
 
 		 306 aa  354  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.741835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2700  oligopeptide transporter permease  56.35 
 
 		 306 aa  353  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0475614  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01218  oligopeptide permease ABC transporter membrane protein  55.05 
 
 		 306 aa  348  6e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2404  Alkaline phosphatase  55.05 
 
 		 306 aa  348  6e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000374689  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2384  oligopeptide transporter permease  55.05 
 
 		 306 aa  348  6e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.423477  hitchhiker  0.00000144694 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1730  oligopeptide transporter permease  55.05 
 
 		 306 aa  348  6e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal  0.0825578 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1392  oligopeptide transporter permease  55.05 
 
 		 306 aa  348  6e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.897764  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1896  oligopeptide transporter permease  55.05 
 
 		 306 aa  348  6e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22801  normal  0.152903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1353  oligopeptide transporter permease  55.05 
 
 		 306 aa  348  6e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00072076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01228  hypothetical protein  55.05 
 
 		 306 aa  348  6e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227767  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1413  oligopeptide transporter permease  55.05 
 
 		 306 aa  348  8e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.933952  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2162  oligopeptide transporter permease  55.05 
 
 		 306 aa  348  8e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0136059  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1959  oligopeptide transporter permease  55.05 
 
 		 306 aa  348  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162478  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2301  oligopeptide transporter permease  54.72 
 
 		 306 aa  347  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1953  oligopeptide transporter permease  55.7 
 
 		 306 aa  347  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1986  oligopeptide transporter permease  55.7 
 
 		 306 aa  347  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.879407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2069  oligopeptide transporter permease  54.72 
 
 		 306 aa  346  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.186457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2287  oligopeptide transporter permease  55.37 
 
 		 306 aa  345  5e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289151  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0610  oligopeptide transporter permease  53.75 
 
 		 306 aa  344  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2194  oligopeptide transporter permease  54.72 
 
 		 306 aa  342  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0464785  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02948  oligopeptide transporter permease  54.07 
 
 		 306 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0022  alkaline phosphatase  53.42 
 
 		 306 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.35 
 
 		 308 aa  329  4e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002960  oligopeptide transport system permease protein OppB  54.79 
 
 		 291 aa  329  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4437  Nickel-transporting ATPase  47.92 
 
 		 312 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.856404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2889  alkaline phosphatase  48.21 
 
 		 307 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0756  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, inner membrane subunit  47.6 
 
 		 312 aa  295  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1480  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppB  47.88 
 
 		 307 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.88 
 
 		 307 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.591349  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4504  alkaline phosphatase  47.6 
 
 		 312 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.293278 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3600  alkaline phosphatase  48.21 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0536  oligopeptide ABC transporter, permease protein  48.53 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178861  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0466  oligopeptide ABC transporter, permease protein  48.21 
 
 		 307 aa  290  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4686  alkaline phosphatase  46.91 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0426131  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1252  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.33 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2902  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  46.33 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0918369  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.49 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3018  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  46.33 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2218  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.01 
 
 		 312 aa  288  9e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0352  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.01 
 
 		 312 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1535  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  46.01 
 
 		 312 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0386  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  46.01 
 
 		 312 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49589  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1725  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  46.01 
 
 		 312 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0591  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.67 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.101579  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.37 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.37 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.37 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0116  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  45.05 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2835  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.71 
 
 		 307 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.06 
 
 		 307 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.37 
 
 		 312 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003658  oligopeptide ABC transporter permease protein  51.32 
 
 		 266 aa  278  9e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.37 
 
 		 312 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2420  nickel-transporting ATPase  47.56 
 
 		 305 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827843  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  46.38 
 
 		 305 aa  278  1e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.06 
 
 		 311 aa  277  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.679809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.41 
 
 		 312 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0105181 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1404  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  47.23 
 
 		 307 aa  275  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  46.05 
 
 		 305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.91 
 
 		 306 aa  265  8.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.373556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.05 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.58 
 
 		 306 aa  248  8e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0952742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2029  phosphoglycerate mutase 1  42.02 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.1 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.046819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.81 
 
 		 313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.636778 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 		 305 aa  242  7e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00478237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.12 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000794188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.31 
 
 		 308 aa  238  8e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.33 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.25 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.25 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.685752 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0336  ABC transporter, permease protein  41.04 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0225977  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000653909  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.472252  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.93 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.32 
 
 		 307 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.93 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000243016  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.88 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0205  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.39 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0186  oligopeptide ABC transporter permease  40.39 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0185  oligopeptide ABC transporter permease protein  40.39 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.681707  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 		 305 aa  225  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121257  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 		 307 aa  225  9e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 		 306 aa  225  9e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0205  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.67 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0229  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.67 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0176  oligopeptide ABC transporter, permease  39.34 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>