137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_5008 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_5008  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  100 
 
 
113 aa  239  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.685027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  53.85 
 
 
109 aa  130  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5001  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  56.7 
 
 
98 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000620576  normal  0.363374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4334  4Fe-4S ferredoxin  46.3 
 
 
111 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.833828  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2619  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.41 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2580  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  47.41 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2625  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.41 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0538354  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3156  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.247179  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1388  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  53.68 
 
 
118 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0307097  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3481  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  55.21 
 
 
111 aa  105  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0547  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.75 
 
 
107 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3288  putative ferrodoxin  52.27 
 
 
125 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4871  putative ferrodoxin  45.19 
 
 
106 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419636  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21920  4Fe-4S ferredoxin protein  47.73 
 
 
130 aa  90.5  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.89 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0358039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.03 
 
 
840 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.43 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0380  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.23 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5270  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.62 
 
 
670 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1441  ferredoxin family protein  37.14 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722291  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3616  iron-sulfur cluster-binding protein  33.93 
 
 
580 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3079  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.62 
 
 
670 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2592  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit  32.43 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0553  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  34.48 
 
 
436 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.238228  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.43 
 
 
429 aa  45.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2358  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.89 
 
 
544 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  38 
 
 
592 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  27.5 
 
 
265 aa  45.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.91 
 
 
211 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.43 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550114  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0934  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.31 
 
 
695 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0413  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.62 
 
 
665 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.295225  normal  0.166033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0381  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.62 
 
 
679 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2764  4Fe-4S ferredoxin  32.69 
 
 
726 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3195  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.62 
 
 
675 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.07 
 
 
559 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  38 
 
 
421 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0496  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
672 aa  43.5  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.747428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2376  putative ferredoxin protein  28.07 
 
 
719 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847567  hitchhiker  0.00764754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3090  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.04 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  40.82 
 
 
500 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0971  ferredoxin  35.59 
 
 
282 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3118  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.69 
 
 
674 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2441  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.69 
 
 
680 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1576  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  31.03 
 
 
791 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1741  photosystem I subunit VII  39.66 
 
 
81 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3277  glycyl-radical activating family protein  35.94 
 
 
318 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0372  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.88 
 
 
418 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0373  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4424  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.93 
 
 
563 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4816  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.79 
 
 
560 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3732  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.59 
 
 
743 aa  42.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.62401 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2477  glycyl-radical enzyme activating protein family  27.94 
 
 
310 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.731109  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3484  photosystem I subunit VII  39.66 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.882203  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.79 
 
 
553 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3788  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.79 
 
 
553 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.904196 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1283  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.31 
 
 
566 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.79 
 
 
553 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5219  photosystem I iron-sulfur protein PsaC  39.66 
 
 
81 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.31 
 
 
699 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0324842  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2185  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.76 
 
 
719 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.900758  normal  0.200774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1166  putative iron-sulfur binding protein  32.69 
 
 
707 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421061  normal  0.487764 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4133  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.79 
 
 
553 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.504849  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1123  iron-sulfur cluster-binding protein  38.46 
 
 
553 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5499  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.69 
 
 
679 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.948929  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1428  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.67 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.79 
 
 
553 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.413842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.31 
 
 
687 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0236  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.79 
 
 
553 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135319 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.79 
 
 
553 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0130862 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2589  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.76 
 
 
719 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131272 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1930  ferredoxin  33.9 
 
 
316 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3544  glycyl-radical enzyme activating protein family  36.62 
 
 
316 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0679  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.77 
 
 
717 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1337  ferredoxin  33.9 
 
 
316 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38 
 
 
369 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.682287  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0449  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.69 
 
 
665 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222499  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.85 
 
 
368 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1023  ferredoxin  33.9 
 
 
290 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0842  ferredoxin  33.9 
 
 
290 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.736914  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1184  ferredoxin  33.9 
 
 
290 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0306  ferredoxin  33.9 
 
 
290 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0340  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.79 
 
 
553 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0200589  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.79 
 
 
559 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0985  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32 
 
 
356 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4904  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.5 
 
 
327 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1481  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.15 
 
 
73 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.859312  normal  0.859235 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4506  iron-sulfur cluster-binding protein  32.14 
 
 
558 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1184  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.68406  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0034  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
517 aa  41.2  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26051  photosystem I subunit VII  37.93 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  32.2 
 
 
188 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0171  photosystem I subunit VII  37.93 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0535  photosystem I subunit VII  37.93 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.966086  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1291  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.3 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.97 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000682014 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  34 
 
 
594 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1176  ferredoxin  33.9 
 
 
290 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0549  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.69 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.116211 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>