39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4842 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  100 
 
 		 433 aa  866    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  33.79 
 
 		 438 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  34.6 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  32.07 
 
 		 421 aa  166  9e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  35.64 
 
 		 313 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  28.69 
 
 		 409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  27.35 
 
 		 467 aa  130  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  28.5 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  29.13 
 
 		 419 aa  126  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  28.83 
 
 		 441 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 428 aa  123  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  28.79 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1179  O-antigen polymerase  27.75 
 
 		 446 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2821  O-antigen polymerase  26.58 
 
 		 437 aa  100  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  26.11 
 
 		 428 aa  94  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  27.56 
 
 		 460 aa  93.6  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  27.18 
 
 		 433 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  33.47 
 
 		 436 aa  87  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  27.04 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  26.39 
 
 		 451 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  27.57 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  25 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  26.18 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  26.44 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  26.44 
 
 		 429 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  29.17 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1378  O-antigen polymerase  26.96 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486003  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  27.31 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1091  exopolysaccharide production protein  24.65 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.802391  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1077  O-antigen polymerase  25.83 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.7973  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  29.22 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4579  O-antigen polymerase  30.07 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  26.51 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  25.93 
 
 		 434 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  29.23 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  29.63 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0257  O-antigen polymerase  29.08 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  22.71 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  22.92 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>