39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2554 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 548 aa  1112    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0847  extracellular solute-binding protein family 1  45.06 
 
 		 556 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0849  extracellular solute-binding protein family 1  39.29 
 
 		 558 aa  365  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.206456  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  37.12 
 
 		 566 aa  297  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2052  extracellular solute-binding protein family 1  36.31 
 
 		 565 aa  296  7e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0150  extracellular solute-binding protein family 1  33.65 
 
 		 567 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3210  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  30.86 
 
 		 569 aa  247  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000204614  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  28.94 
 
 		 573 aa  223  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 533 aa  89.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 		 505 aa  80.5  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0862  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 		 568 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 556 aa  70.9  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 531 aa  68.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2458  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 588 aa  67  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 559 aa  66.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 536 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 		 552 aa  63.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 541 aa  62  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.25 
 
 		 559 aa  58.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 585 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  21.98 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 557 aa  57  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1188  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 587 aa  56.6  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.93 
 
 		 544 aa  56.6  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 553 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 522 aa  52  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  20.45 
 
 		 530 aa  50.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 549 aa  50.4  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 542 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  22.04 
 
 		 551 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  21.04 
 
 		 558 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.71 
 
 		 503 aa  48.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  22.55 
 
 		 553 aa  47  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  21.64 
 
 		 553 aa  46.2  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  20.62 
 
 		 482 aa  44.3  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0087  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 		 175 aa  43.9  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000254979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 420 aa  43.5  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>