More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2078 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2078  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
329 aa  684    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0519  oxidoreductase domain-containing protein  52.89 
 
 
328 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00249264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0495  oxidoreductase domain-containing protein  52.89 
 
 
328 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0650214  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1283  oxidoreductase domain protein  52.29 
 
 
328 aa  359  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0628466  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2507  oxidoreductase domain protein  23.81 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762014  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6100  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207397  normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2165  oxidoreductase domain protein  21.92 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  25.27 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  24.24 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  25.27 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  27.65 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  24.83 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6513  oxidoreductase domain protein  24.82 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  25.1 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.09 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  27.16 
 
 
369 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4491  oxidoreductase-like  23.66 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1594  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  23.83 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  24.69 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5583  oxidoreductase  24.48 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  25.55 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  24.52 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3326  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.16 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  21.47 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  22.56 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  21.94 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  32.14 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  21.94 
 
 
370 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07991  putative oxidoreductase  27.81 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.716989  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  19.78 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  24.62 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  25.1 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  21.5 
 
 
336 aa  65.9  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4054  oxidoreductase domain protein  23.72 
 
 
357 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  23.27 
 
 
427 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0600  oxidoreductase domain-containing protein  23.86 
 
 
362 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.55 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.73 
 
 
360 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  29.96 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.73 
 
 
360 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  23.95 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  30.6 
 
 
344 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 
325 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01560  predicted dehydrogenase  22.48 
 
 
362 aa  63.9  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  23.47 
 
 
373 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.28 
 
 
331 aa  63.5  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 
349 aa  63.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.48 
 
 
330 aa  63.2  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  29.27 
 
 
438 aa  62.8  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  21.24 
 
 
353 aa  62.8  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01970  predicted dehydrogenase  22.51 
 
 
323 aa  62.8  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.395105 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4492  oxidoreductase-like  25.36 
 
 
342 aa  62.4  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  24.65 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  25.74 
 
 
375 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 
349 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 
341 aa  62  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  27.51 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  27.51 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  28.67 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.61 
 
 
334 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.14 
 
 
329 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  27.55 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  27.86 
 
 
390 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  24.37 
 
 
344 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.14 
 
 
428 aa  60.5  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  29.94 
 
 
366 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  25.85 
 
 
387 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  29.94 
 
 
366 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  28.3 
 
 
355 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  27.27 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  23.08 
 
 
356 aa  60.1  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1648  oxidoreductase domain protein  26.37 
 
 
360 aa  59.7  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 
353 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  24.75 
 
 
387 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  23.19 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  24.24 
 
 
357 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  27.52 
 
 
393 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  23.92 
 
 
364 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 
425 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  22.73 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  34.31 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  28.68 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  30.94 
 
 
346 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  22.22 
 
 
347 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.21 
 
 
347 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08431  putative oxidoreductase  30.51 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  25.46 
 
 
363 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  20 
 
 
474 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
667 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  25.32 
 
 
455 aa  57.4  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  22.79 
 
 
496 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>