More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1115 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1115  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
197 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  35.05 
 
 
194 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.02 
 
 
194 aa  104  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.38 
 
 
187 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.38 
 
 
194 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.71 
 
 
195 aa  101  7e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.66 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.32 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.91 
 
 
199 aa  95.5  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0414  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.32 
 
 
192 aa  95.5  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.65 
 
 
198 aa  95.9  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.41 
 
 
195 aa  95.1  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.98 
 
 
192 aa  95.1  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.69 
 
 
197 aa  95.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.34 
 
 
200 aa  95.1  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.14 
 
 
193 aa  94.7  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.79 
 
 
202 aa  94.7  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.82 
 
 
200 aa  94.7  8e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.12 
 
 
197 aa  94.4  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0837  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.48 
 
 
209 aa  94  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.16 
 
 
193 aa  94  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  32 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.65 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.65 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.02 
 
 
199 aa  92.4  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1013  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
197 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.81 
 
 
193 aa  92  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3126  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.76 
 
 
197 aa  92  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.735644  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.81 
 
 
193 aa  92  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
205 aa  92  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.31 
 
 
199 aa  92  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0020  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.64 
 
 
210 aa  91.3  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0018  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.64 
 
 
210 aa  91.3  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1206  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.65 
 
 
200 aa  90.5  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000238701  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.04 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.52 
 
 
205 aa  90.5  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.5 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0639  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.18 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.5 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0911  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.82 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.5 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.62 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.66 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.16 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12320  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.24 
 
 
194 aa  89  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0086  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.86 
 
 
192 aa  89  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.61 
 
 
201 aa  89  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.39 
 
 
202 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.02 
 
 
202 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2114  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.47 
 
 
208 aa  88.2  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.948496  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.16 
 
 
196 aa  88.6  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00649233  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.71 
 
 
197 aa  88.2  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2522  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.15 
 
 
201 aa  88.2  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000919135  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2556  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.5 
 
 
193 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209185  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  29.9 
 
 
196 aa  88.2  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  33.66 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.9 
 
 
202 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17520  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  30.43 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176122 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2472  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.65 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1010  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.52 
 
 
197 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.806868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  33.66 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3827  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.53 
 
 
200 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0952  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.5 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.04 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.66 
 
 
201 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.07 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3775  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
193 aa  85.9  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.07 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1333  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
203 aa  85.9  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000329731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.07 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000176513  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1938  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.07 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00077844  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.13 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.07 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.58 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.07 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869116  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.07 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000236908  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.58 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1797  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.88 
 
 
214 aa  85.5  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113537 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1416  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.86 
 
 
220 aa  85.5  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.685038 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.93 
 
 
196 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.71 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2820  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.63 
 
 
213 aa  85.5  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.480869 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.71 
 
 
203 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0894  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.58 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00161936  normal  0.093504 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1414  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.68 
 
 
199 aa  85.9  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000662939  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.71 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.71 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.71 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2064  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.34 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.07 
 
 
203 aa  85.5  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0926  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.87 
 
 
194 aa  85.1  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
199 aa  85.1  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>