More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4350 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008538  Arth_4350  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  100 
 
 
297 aa  586  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0629  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  44.29 
 
 
292 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650188  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0536  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  44.29 
 
 
297 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732452  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1701  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  44.29 
 
 
292 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0870756  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1676  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  44.29 
 
 
292 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1650  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  44.29 
 
 
292 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345161  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0547  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  44.29 
 
 
292 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5650  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  44.29 
 
 
292 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328069  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5447  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  44.56 
 
 
287 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5844  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  44.56 
 
 
287 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3089  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.45 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3343  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.72 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2389  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  30.51 
 
 
289 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0261  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.29 
 
 
305 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0646517 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1133  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.2 
 
 
301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3369  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  32.26 
 
 
303 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00318158  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3102  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.77 
 
 
293 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3379  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.74 
 
 
291 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0410434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1177  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.8 
 
 
295 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.383553  normal  0.478459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1143  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.8 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1923  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.5 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238794  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0958  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.17 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4274  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.8 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347219  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3990  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.85 
 
 
303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0351  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  30.14 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0845  tartronate semialdehyde reductase  35.86 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2369  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.94 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0209  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  29.52 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3393  tartronate semialdehyde reductase  36.87 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0073  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.36 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  34.47 
 
 
296 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2119  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.17 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0276919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1160  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.87 
 
 
295 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206524  normal  0.0135112 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6528  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.28 
 
 
297 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186276  normal  0.100696 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0588  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.25 
 
 
287 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3956  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.8 
 
 
302 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.33 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5561  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.86 
 
 
283 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1600  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.69 
 
 
293 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0331  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.88 
 
 
287 aa  112  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2197  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.77 
 
 
290 aa  112  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206144  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  30.15 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4859  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.57 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748222  normal  0.158599 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0811  tartronate semialdehyde reductase  35.86 
 
 
294 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1933  oxidoreductase protein  31.42 
 
 
290 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.508408  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase GcxR  32.26 
 
 
295 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.902474  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0594  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.8 
 
 
299 aa  109  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.84188  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3011  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  30.07 
 
 
287 aa  109  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101253  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2944  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.41 
 
 
309 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.541427 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6125  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.83 
 
 
264 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0210  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.27 
 
 
284 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.866351  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.86 
 
 
294 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0860064 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1953  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.83 
 
 
297 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  32.66 
 
 
296 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.66 
 
 
296 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  32.83 
 
 
296 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  32.66 
 
 
296 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3153  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.2 
 
 
304 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  32.83 
 
 
296 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  32.66 
 
 
294 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  32.66 
 
 
294 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  32.66 
 
 
294 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  32.83 
 
 
296 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  32.66 
 
 
296 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  32.83 
 
 
296 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  32.83 
 
 
296 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  32.66 
 
 
294 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  32.66 
 
 
294 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0284  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  35.21 
 
 
292 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.42 
 
 
292 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3553  tartronate semialdehyde reductase  37.37 
 
 
294 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2161  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.08 
 
 
299 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1500  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.33 
 
 
299 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.921564  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1632  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.33 
 
 
303 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3450  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.2 
 
 
307 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1297  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.94 
 
 
294 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1934  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  29.86 
 
 
294 aa  106  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43420  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.88 
 
 
296 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.164862  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2547  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.68 
 
 
286 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0364167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2007  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family protein  33.2 
 
 
287 aa  105  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3480  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.86 
 
 
304 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1316  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.2 
 
 
296 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823499  normal  0.0105684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1318  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.43 
 
 
291 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.676438  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2069  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase related enzyme  33.97 
 
 
287 aa  104  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.29 
 
 
293 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1251  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.78 
 
 
298 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1159  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.81 
 
 
292 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0699  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.18 
 
 
286 aa  103  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000621245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2771  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.94 
 
 
296 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0891841  normal  0.489794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21180  putative 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.15 
 
 
296 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.542348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1596  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.8 
 
 
297 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00205037  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1975  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.89 
 
 
291 aa  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.154488  hitchhiker  0.00242573 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3293  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.53 
 
 
306 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1123  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.06 
 
 
299 aa  102  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.356226 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1977  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.69 
 
 
287 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0142603 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3831  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.71 
 
 
296 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3283  transmembrane 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase oxidoreductase protein  31.29 
 
 
303 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3624  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.51 
 
 
297 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1714  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.93 
 
 
309 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.280932  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45020  putative oxidoreductase  29.71 
 
 
296 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.820061  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>