294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4038 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4038  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
144 aa  297  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3832  thioesterase superfamily protein  95.14 
 
 
144 aa  283  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20510  acyl-CoA hydrolase  75.97 
 
 
150 aa  211  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05860  hypothetical protein  76.19 
 
 
134 aa  201  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0551  hypothetical protein  75.4 
 
 
134 aa  201  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5067  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  73.02 
 
 
131 aa  200  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0461  thioesterase superfamily protein  73.02 
 
 
131 aa  199  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7031  thioesterase superfamily protein  73.77 
 
 
159 aa  196  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0529505  hitchhiker  0.00000000906305 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0490  thioesterase superfamily protein  69.53 
 
 
133 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5279  thioesterase superfamily protein  72.22 
 
 
135 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5024  thioesterase superfamily protein  69.53 
 
 
133 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4975  thioesterase superfamily protein  69.53 
 
 
133 aa  193  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107166  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4848  thioesterase superfamily protein  69.53 
 
 
133 aa  193  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.141512  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4135  thioesterase superfamily protein  72.95 
 
 
160 aa  192  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1723  thioesterase superfamily protein  66.14 
 
 
131 aa  186  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10248  thioesterase family protein domain protein  60.63 
 
 
129 aa  159  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00150386  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0794  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  58.62 
 
 
121 aa  137  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218996  normal  0.0133262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1159  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
122 aa  128  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00426691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1353  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2765  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 
122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0173691  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2843  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 
122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0401638  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2941  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 
122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760683  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1486  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  48.28 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1240  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1318  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 
122 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1309  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 
122 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.847429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3041  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 
122 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.957748  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1345  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 
122 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1696  thioesterase family protein  48.78 
 
 
125 aa  121  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303934  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1251  thioesterase superfamily protein  49.14 
 
 
122 aa  120  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.757255 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2461  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  45.69 
 
 
122 aa  120  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101998  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02806  thioesterase family protein  50.43 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0316832  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1342  thioesterase superfamily protein  49.57 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2800  thioesterase superfamily protein  39.66 
 
 
122 aa  100  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  36.44 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  36.28 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 
129 aa  62.8  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
176 aa  60.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1510  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase, putative  33.64 
 
 
129 aa  60.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.14 
 
 
118 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 
154 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1460  putative long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  33.64 
 
 
129 aa  60.5  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  32.46 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  32.46 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2125  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  32.26 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0941  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0825  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216993  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  31.3 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0621  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.91 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  28.46 
 
 
159 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1926  acyl-CoA thioester hydrolase  31.3 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00369936 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  31.3 
 
 
169 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1410  acyl-CoA thioester hydrolase  31.3 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.429  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1863  acyl-CoA thioester hydrolase  31.3 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472639  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1869  acyl-CoA thioester hydrolase  31.3 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.592837  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1592  acyl-CoA thioester hydrolase  31.3 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849233 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  29.27 
 
 
176 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1900  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  29.27 
 
 
176 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4027  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000934062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
151 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 
328 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 
170 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4080  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789165  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  34.19 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  29.92 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0782  thioesterase superfamily protein  38.16 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000656912  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1626  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.928408  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
260 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 
327 aa  53.9  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01905  acyl-CoA thioester hydrolase  33.33 
 
 
163 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
143 aa  53.5  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.71789 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1348  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
158 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1268  acyl-CoA hydrolase  29.2 
 
 
154 aa  53.5  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.415542  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0824  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1614  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00678446  normal  0.171125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>