More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3385 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
313 aa  630  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.359427  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.65 
 
 
314 aa  500  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000089983 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.04 
 
 
310 aa  335  7e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.06 
 
 
309 aa  334  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.114297  normal  0.0929805 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07470  carbohydrate ABC transporter membrane protein  56.74 
 
 
304 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.04 
 
 
303 aa  315  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.68 
 
 
317 aa  295  6e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  43.75 
 
 
318 aa  219  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  36.93 
 
 
288 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
316 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 
317 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
309 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  37.15 
 
 
307 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 
307 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
312 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.05 
 
 
299 aa  183  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
306 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
279 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.983189  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
316 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.21 
 
 
312 aa  178  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.633875  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
309 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
292 aa  176  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
314 aa  175  9e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000137508  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1290  ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
311 aa  174  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.264329 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  34.66 
 
 
293 aa  172  9e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  33.33 
 
 
315 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
314 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0166533  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
314 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000200699  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
292 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
294 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
308 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0478  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  35.31 
 
 
310 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  35.03 
 
 
321 aa  170  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  35.31 
 
 
310 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  35.56 
 
 
294 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0604  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  35.19 
 
 
310 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
317 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.10809  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
310 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0623  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  35.31 
 
 
310 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
316 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
316 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4735  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  35.31 
 
 
310 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0630  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  34.97 
 
 
310 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
286 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  34.97 
 
 
310 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
328 aa  169  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
305 aa  169  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.028536  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
326 aa  168  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
315 aa  169  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0536  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  34.97 
 
 
310 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0567  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  34.97 
 
 
310 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.4 
 
 
275 aa  168  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
319 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14469  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
318 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.415839 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
293 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  34.86 
 
 
293 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
320 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.253823  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
297 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
311 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28370  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.32 
 
 
287 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
314 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  32.7 
 
 
318 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
314 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00699527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
305 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99861  hitchhiker  0.000381845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.72 
 
 
354 aa  165  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
317 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5641  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  hitchhiker  0.000478367 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.498676  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1691  oligogalacturonide ABC tansporter, permease protein  36.82 
 
 
296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.041328  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  34.64 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
296 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000392628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
292 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
315 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
300 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
313 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
297 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.613698  normal  0.150229 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.1 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
296 aa  162  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.243021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3909  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
305 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  32.76 
 
 
317 aa  162  7e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2645  oligogalacturonide ABC tansporter, permease  36.46 
 
 
296 aa  162  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.952468  normal  0.0439933 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.83 
 
 
291 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.28 
 
 
310 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155614  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
294 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
302 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.159905  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>