More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2388 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2388  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
390 aa  776    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059895  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2142  gamma-glutamyl kinase  81.56 
 
 
383 aa  565  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000109405 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2280  glutamate 5-kinase  61.14 
 
 
382 aa  440  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.000593596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2179  gamma-glutamyl kinase  59.35 
 
 
388 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7269  glutamate 5-kinase  61.52 
 
 
375 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3454  glutamate 5-kinase  65.77 
 
 
382 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.281717  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2256  glutamate 5-kinase  60.76 
 
 
372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  56.28 
 
 
393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2457  glutamate 5-kinase  59.62 
 
 
374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0853623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1591  glutamate 5-kinase  61.41 
 
 
373 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.107077  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0386  gamma-glutamyl kinase  61.05 
 
 
385 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.969729  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7268  Glutamate 5-kinase  60.6 
 
 
374 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3448  gamma-glutamyl kinase  59.24 
 
 
371 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0431842  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0457  gamma-glutamyl kinase  58.97 
 
 
369 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1625  glutamate 5-kinase  60.6 
 
 
379 aa  385  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.795744 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10140  glutamate 5-kinase  57.71 
 
 
401 aa  387  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.268625  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11430  glutamate 5-kinase  56.76 
 
 
419 aa  381  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1551  glutamate 5-kinase  60.43 
 
 
388 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0199674  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3377  glutamate 5-kinase  56.9 
 
 
385 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1223  gamma-glutamyl kinase  57.34 
 
 
371 aa  357  9.999999999999999e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.826884  normal  0.429771 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0759  gamma-glutamyl kinase  54.03 
 
 
393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12530  glutamate 5-kinase  55.01 
 
 
372 aa  356  5e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18240  glutamate 5-kinase  52.79 
 
 
381 aa  355  5.999999999999999e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205431  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5257  gamma-glutamyl kinase  56.52 
 
 
371 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1190  glutamate 5-kinase  58.24 
 
 
376 aa  340  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1506  glutamate 5-kinase  54.11 
 
 
412 aa  339  5e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.018123  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3943  gamma-glutamyl kinase  53.8 
 
 
366 aa  339  5e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.82203  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1221  glutamate 5-kinase  52.03 
 
 
381 aa  335  7.999999999999999e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2062  glutamate 5-kinase  53.35 
 
 
371 aa  334  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1619  gamma-glutamyl kinase  51.22 
 
 
377 aa  325  6e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1476  glutamate 5-kinase  54.32 
 
 
377 aa  325  6e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.324242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3552  gamma-glutamyl kinase  51.34 
 
 
377 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3547  gamma-glutamyl kinase  51.34 
 
 
377 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3620  gamma-glutamyl kinase  51.34 
 
 
377 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12466  gamma-glutamyl kinase  53.21 
 
 
376 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0062273  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2638  gamma-glutamyl kinase  50.81 
 
 
370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571197  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  48.12 
 
 
373 aa  296  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  43.17 
 
 
369 aa  277  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  44.3 
 
 
378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  41.8 
 
 
372 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  45.18 
 
 
367 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  44.35 
 
 
367 aa  267  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  42.63 
 
 
376 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  45.33 
 
 
372 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  43.31 
 
 
383 aa  266  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  45.33 
 
 
372 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0430  glutamate 5-kinase  44.02 
 
 
385 aa  266  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  45.04 
 
 
372 aa  266  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  43.72 
 
 
369 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  43.92 
 
 
378 aa  262  6e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  42.66 
 
 
373 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  39.32 
 
 
390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  41.18 
 
 
373 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  43.63 
 
 
377 aa  257  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  44.95 
 
 
374 aa  257  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  41.53 
 
 
374 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  42.78 
 
 
376 aa  255  8e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  38.77 
 
 
373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  42.03 
 
 
376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  41.69 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  40.16 
 
 
373 aa  253  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  43.2 
 
 
375 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  42.25 
 
 
375 aa  252  9.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  40.7 
 
 
373 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  43.8 
 
 
363 aa  250  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  38.24 
 
 
373 aa  250  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  40.27 
 
 
384 aa  250  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  42.36 
 
 
374 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3029  gamma-glutamyl kinase  39.51 
 
 
367 aa  249  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0863421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  43.09 
 
 
368 aa  249  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  41.64 
 
 
372 aa  249  6e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  41.94 
 
 
372 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  41.94 
 
 
372 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2251  gamma-glutamyl kinase  39.78 
 
 
367 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00921401  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  45.37 
 
 
366 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  42.67 
 
 
372 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  42.27 
 
 
369 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  42.27 
 
 
369 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  39.46 
 
 
375 aa  247  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  42.47 
 
 
374 aa  246  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  39.56 
 
 
371 aa  246  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2790  gamma-glutamyl kinase  38.96 
 
 
367 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.558621  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  41.94 
 
 
372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2994  gamma-glutamyl kinase  39.51 
 
 
367 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.13461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  41.67 
 
 
372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  41.46 
 
 
371 aa  246  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  41.6 
 
 
372 aa  245  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2989  gamma-glutamyl kinase  39.51 
 
 
414 aa  245  9e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  41.78 
 
 
372 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  41.78 
 
 
372 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  42.13 
 
 
372 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  39.67 
 
 
369 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  41.46 
 
 
379 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  41.94 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  41.4 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  42.74 
 
 
377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  42.78 
 
 
374 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2712  gamma-glutamyl kinase  39.24 
 
 
386 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  40.53 
 
 
372 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  39.47 
 
 
374 aa  243  6e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>