142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1057 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  100 
 
 
546 aa  1118    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  70.48 
 
 
559 aa  784    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  56.23 
 
 
547 aa  550  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1011  alkaline phosphatase  53.29 
 
 
483 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  50.37 
 
 
520 aa  490  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  51.98 
 
 
518 aa  491  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  46.69 
 
 
532 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  49.81 
 
 
519 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  52.28 
 
 
519 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  49.91 
 
 
520 aa  465  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  46.65 
 
 
527 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  49.22 
 
 
520 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  47.21 
 
 
528 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  45.13 
 
 
527 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  47.7 
 
 
513 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  48.35 
 
 
567 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  49.02 
 
 
517 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  46.47 
 
 
516 aa  449  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  47.64 
 
 
573 aa  445  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  47.9 
 
 
523 aa  444  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  47.66 
 
 
514 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  45.41 
 
 
523 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2182  alkaline phosphatase  43.92 
 
 
526 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000857232 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  43.81 
 
 
539 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  43.63 
 
 
539 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  42.83 
 
 
524 aa  412  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1503  putative alkaline phosphatase (PhoD); putative signal peptide  44.1 
 
 
522 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.337641  normal  0.661577 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  42.01 
 
 
539 aa  405  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4157  secreted alkaline phosphatase protein  43.09 
 
 
526 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0120038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  41.58 
 
 
541 aa  391  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  40.72 
 
 
520 aa  350  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  26.44 
 
 
727 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  28.39 
 
 
529 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0221  hypothetical protein  38.07 
 
 
191 aa  97.1  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  28.31 
 
 
585 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  27.13 
 
 
549 aa  94.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.95 
 
 
555 aa  94  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  26.58 
 
 
523 aa  91.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  25.25 
 
 
587 aa  90.5  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  26.74 
 
 
516 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  27.49 
 
 
545 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4022  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  26.17 
 
 
573 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  26.67 
 
 
596 aa  87  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.56 
 
 
540 aa  86.7  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  25.35 
 
 
530 aa  85.1  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  24.84 
 
 
523 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  26.97 
 
 
523 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  25.79 
 
 
531 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  24.63 
 
 
523 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  25.06 
 
 
679 aa  82.4  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  24.94 
 
 
557 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  24.2 
 
 
534 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  26.39 
 
 
540 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  26.15 
 
 
530 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.59 
 
 
573 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  26.68 
 
 
555 aa  81.3  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  25.38 
 
 
519 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  25.17 
 
 
523 aa  80.5  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  26.82 
 
 
563 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  27.7 
 
 
522 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  26.23 
 
 
540 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  24.87 
 
 
583 aa  79.7  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  25.32 
 
 
521 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  24.48 
 
 
606 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.51 
 
 
524 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  25.46 
 
 
550 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  25.55 
 
 
552 aa  79.3  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  26.58 
 
 
582 aa  79  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  26.8 
 
 
535 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  25.25 
 
 
538 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  24.74 
 
 
617 aa  78.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  25.16 
 
 
538 aa  78.2  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
530 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  25.74 
 
 
511 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  25.48 
 
 
538 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  24.76 
 
 
564 aa  76.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  26.49 
 
 
541 aa  75.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  25.95 
 
 
554 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  26.04 
 
 
541 aa  74.7  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  24.07 
 
 
674 aa  73.9  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  25.06 
 
 
589 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  25.11 
 
 
532 aa  72.8  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  24.67 
 
 
531 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  24.11 
 
 
576 aa  71.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  24.39 
 
 
600 aa  71.6  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  24.89 
 
 
574 aa  71.2  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  24.72 
 
 
585 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  26.45 
 
 
589 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  23.37 
 
 
589 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  25.48 
 
 
558 aa  69.3  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  23.76 
 
 
529 aa  69.3  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  29.86 
 
 
513 aa  68.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  23.72 
 
 
522 aa  68.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  27.44 
 
 
670 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  25.5 
 
 
523 aa  68.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  23.27 
 
 
590 aa  66.6  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  24.05 
 
 
710 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  24.86 
 
 
531 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  25.37 
 
 
529 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  25.21 
 
 
534 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>