135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0247 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0247  urease accessory protein UreD  100 
 
 		 261 aa  530  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0396  Urease accessory protein UreD  81.99 
 
 		 321 aa  444  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03480  urease accessory protein UreH  50.38 
 
 		 284 aa  251  6e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  34.48 
 
 		 274 aa  185  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  34.77 
 
 		 273 aa  184  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2318  urease accessory protein UreD  34.77 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00527457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2361  urease accessory protein UreD  34.77 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.361313  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1875  urease accessory protein UreD  31.64 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.37143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  30.86 
 
 		 271 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0473  urease accessory protein UreD  27.76 
 
 		 287 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.744472  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0329  urease accessory protein  27.97 
 
 		 279 aa  125  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1812  urease accessory protein UreD  28.51 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  31.3 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  32.53 
 
 		 315 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  29.46 
 
 		 293 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  29.07 
 
 		 293 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  29.34 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  30.38 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1390  urease accessory protein UreD  30.58 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1092  urease accessory protein UreD  29.69 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  28.57 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  28.96 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  27.35 
 
 		 293 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  25.33 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  28.08 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  27.05 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  26.61 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  24.45 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0977  Urease accessory protein UreD  36.3 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4831  urease accessory protein UreD  23.01 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  27.86 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1083  urease accessory protein UreD  24.88 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1137  urease accessory protein UreD  24.88 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3376  urease accessory protein UreD  28.52 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  33.09 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1301  urease accessory protein UreD  26.2 
 
 		 311 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1463  Urease accessory protein UreD  26.2 
 
 		 311 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3971  Urease accessory protein UreD  29.46 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  31.47 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  29.1 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  29.79 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4009  urease accessory protein UreD  38.14 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  31.78 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0724  Urease accessory protein UreD  24.47 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  28.46 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  28.46 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  28.46 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  28.46 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  28.46 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  28.46 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  27.38 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  30 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0424  urease accessory protein UreD  33.33 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  33.33 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  29.5 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  34.43 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2487  urease accessory protein UreD  33.63 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  28.46 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0873  urease accessory protein UreD  32.46 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4212  urease accessory protein UreD  28.17 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1414  urease accessory protein UreD  29.26 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421382 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  32.74 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  33.64 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29781  urease accessory protein UreD  26.52 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1478  Urease accessory protein UreD  28.97 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0751352  normal  0.245102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1082  urease accessory protein UreD  31.47 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4414  Urease accessory protein UreD  23.51 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  31.86 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  35.43 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1004  urease accessory protein UreD  40.43 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  31.54 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  29.68 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0749  urease accessory protein UreD  23.83 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  31.21 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  31.65 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  29.73 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08921  urease accessory protein UreD  27.43 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00733999  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  26.18 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  29.79 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  28.06 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  30.94 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  26.46 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  28.68 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  28.47 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0833  urease accessory protein UreD  26.55 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  29.55 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  37.11 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  27.54 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  29.1 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  22.18 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  25.68 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  32.28 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  34.11 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  29.73 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2254  urease accessory protein D  26.72 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0059  Urease accessory protein UreD  27.98 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  26.89 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1555  Urease accessory protein UreD  24.39 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  31.5 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  29.05 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>