More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0213 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
140 aa  284  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  89.55 
 
 
135 aa  248  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  73.88 
 
 
136 aa  218  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  72.11 
 
 
147 aa  214  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  72.18 
 
 
135 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  72.99 
 
 
148 aa  211  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  71.11 
 
 
141 aa  209  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  75 
 
 
150 aa  205  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  73.44 
 
 
150 aa  204  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  68.38 
 
 
139 aa  202  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  67.91 
 
 
141 aa  202  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  74.22 
 
 
143 aa  201  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  71.21 
 
 
135 aa  201  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  71.88 
 
 
138 aa  200  6e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  72.66 
 
 
136 aa  196  9e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  67.15 
 
 
139 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  67.18 
 
 
453 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  67.16 
 
 
215 aa  195  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  70.31 
 
 
137 aa  190  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  70.31 
 
 
136 aa  189  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  66.67 
 
 
136 aa  187  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  73.73 
 
 
138 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  64.75 
 
 
498 aa  186  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  65.41 
 
 
136 aa  184  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  67.2 
 
 
139 aa  183  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  63.28 
 
 
223 aa  183  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  64.62 
 
 
294 aa  181  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  63.28 
 
 
217 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  63.28 
 
 
217 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  63.28 
 
 
217 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  63.28 
 
 
225 aa  177  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  62.5 
 
 
225 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  59.69 
 
 
222 aa  173  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  60.47 
 
 
157 aa  168  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.81 
 
 
227 aa  154  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  53.97 
 
 
144 aa  153  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.59 
 
 
219 aa  152  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.47 
 
 
227 aa  152  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  51.52 
 
 
408 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  54.74 
 
 
347 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  52.59 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.17 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  52.27 
 
 
337 aa  142  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  56.39 
 
 
349 aa  136  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.91 
 
 
229 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  47.76 
 
 
337 aa  130  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  47.66 
 
 
137 aa  122  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.96 
 
 
147 aa  122  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  49.59 
 
 
336 aa  121  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  48.06 
 
 
135 aa  120  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  45.31 
 
 
132 aa  117  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0827  arsenate reductase ArsC  46.03 
 
 
132 aa  117  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.848042  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0834  arsenate reductase ArsC  46.03 
 
 
132 aa  116  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0765762  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  42.11 
 
 
148 aa  114  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  41.91 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  45.6 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.14 
 
 
151 aa  105  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  45.8 
 
 
132 aa  105  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.54 
 
 
140 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.69 
 
 
145 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3649  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.81 
 
 
140 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  40.46 
 
 
137 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0759  protein tyrosine phosphatase  35.34 
 
 
134 aa  101  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  43.41 
 
 
131 aa  100  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2364  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.44 
 
 
143 aa  100  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3381  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  42.19 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  41.41 
 
 
130 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1151  protein tyrosine phosphatase  38.1 
 
 
135 aa  97.1  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.734806  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1685  protein tyrosine phosphatase  34.65 
 
 
135 aa  97.1  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1811  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.32 
 
 
140 aa  97.1  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178186  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  39.13 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  38.17 
 
 
133 aa  96.7  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2433  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.57 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1444  protein tyrosine phosphatase  37.69 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11640  protein-tyrosine-phosphatase  37.31 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.181279 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  36.05 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.6 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3332  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  40.31 
 
 
131 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1477  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 
135 aa  95.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.334169  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0143  arsenate reductase  37.96 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.596044  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  36.43 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  37.86 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2155  protein tyrosine phosphatase  41.27 
 
 
136 aa  91.3  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  38.52 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1203  protein tyrosine phosphatase  32.31 
 
 
135 aa  91.3  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  38.19 
 
 
148 aa  89.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0969  protein tyrosine phosphatase  37.6 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.420605  normal  0.145291 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1304  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.5 
 
 
133 aa  88.6  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  43.93 
 
 
258 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21340  protein-tyrosine-phosphatase  36.15 
 
 
255 aa  88.2  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.13 
 
 
143 aa  88.2  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  41.6 
 
 
299 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0355  protein tyrosine phosphatase  36.09 
 
 
137 aa  87  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  38.46 
 
 
138 aa  87  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3220  protein tyrosine phosphatase  38.93 
 
 
142 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  38.13 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1068  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>