More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0109 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
335 aa  667    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  86.97 
 
 
310 aa  490  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  52.92 
 
 
306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  50.16 
 
 
326 aa  271  9e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  47.63 
 
 
334 aa  263  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  48.08 
 
 
329 aa  249  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  51.13 
 
 
303 aa  249  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  46.53 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  46.53 
 
 
317 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  46.53 
 
 
317 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  49.35 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  48.38 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  48.86 
 
 
317 aa  243  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  45.51 
 
 
309 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  46.6 
 
 
346 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  42.81 
 
 
303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  44.22 
 
 
309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  48.59 
 
 
328 aa  205  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  42.46 
 
 
332 aa  204  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  43.65 
 
 
316 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  45.63 
 
 
300 aa  203  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  40.49 
 
 
317 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  43.13 
 
 
316 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  41.51 
 
 
320 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  42.62 
 
 
333 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  39.3 
 
 
306 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  36.71 
 
 
306 aa  172  9e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  38.66 
 
 
326 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  40.51 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  38.94 
 
 
320 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  37.85 
 
 
314 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  36.83 
 
 
321 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  36.79 
 
 
312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  38.56 
 
 
319 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  37.77 
 
 
312 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  37.46 
 
 
306 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  34.47 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  35.71 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  35.71 
 
 
312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  34.6 
 
 
308 aa  145  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  37.27 
 
 
313 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  36.19 
 
 
306 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  37.78 
 
 
311 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  36.51 
 
 
306 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  34.18 
 
 
309 aa  142  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  33.97 
 
 
308 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  37.77 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  33.65 
 
 
308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  36.05 
 
 
308 aa  139  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  35.42 
 
 
307 aa  139  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  29.63 
 
 
315 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  35.29 
 
 
338 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  34.69 
 
 
316 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  35.22 
 
 
309 aa  138  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  34.77 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  34.16 
 
 
308 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  32.28 
 
 
308 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  35.33 
 
 
310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  37.96 
 
 
310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  38.12 
 
 
312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  30.77 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  37.85 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  33.33 
 
 
312 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  34.39 
 
 
322 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  37.65 
 
 
310 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  31.43 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  32.58 
 
 
306 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  31.43 
 
 
308 aa  127  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  33.85 
 
 
315 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  38.41 
 
 
315 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  32.18 
 
 
306 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  32.72 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  34.46 
 
 
323 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  29.19 
 
 
319 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  35 
 
 
317 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  31.13 
 
 
319 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  27.98 
 
 
323 aa  113  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  33.23 
 
 
344 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7036  fructokinase  37.86 
 
 
251 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  32.4 
 
 
336 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.05 
 
 
322 aa  106  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  26.9 
 
 
313 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  33.02 
 
 
304 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  32.84 
 
 
322 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  31.6 
 
 
306 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  26.75 
 
 
313 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.44 
 
 
326 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  32.7 
 
 
304 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  26.9 
 
 
313 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  26.9 
 
 
313 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  32.92 
 
 
332 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  26.9 
 
 
313 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  29.47 
 
 
337 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  25.16 
 
 
315 aa  99  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  27.81 
 
 
321 aa  99  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  35.54 
 
 
284 aa  98.2  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  24.84 
 
 
315 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  28.36 
 
 
315 aa  97.1  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  31.7 
 
 
298 aa  96.3  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  31.32 
 
 
307 aa  96.3  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>