243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1359 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1359  LrgB family protein  100 
 
 		 230 aa  444  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957145  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  47.64 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  44.39 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  47.71 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  47.27 
 
 		 236 aa  181  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0707  LrgB family protein  42.79 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000904549  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00860  putative effector of murein hydrolase  42.65 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2909  LrgB family protein  42.31 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  36.94 
 
 		 244 aa  161  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  38.64 
 
 		 239 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  36.68 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  37.5 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  37.96 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  37.96 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1949  LrgB family protein  43.32 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3956  antiholin-like protein LrgB  39.64 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1482  putative effector of murein hydrolase  38.67 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0187991  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  35.89 
 
 		 239 aa  151  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08310  membrane protein, LrgB family  34.72 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.298678  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  35.07 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5619  antiholin-like protein LrgB  39.27 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5571  antiholin-like protein LrgB  39.27 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5293  antiholin-like protein LrgB  39.27 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5120  antiholin-like protein LrgB  39.27 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5135  antiholin-like protein LrgB  39.27 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0238416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5689  antiholin-like protein LrgB  39.27 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  34.43 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5534  antiholin-like protein LrgB  39.27 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5386  antiholin-like protein LrgB  39.27 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.674425  normal  0.703231 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5563  antiholin-like protein LrgB  39.27 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0159  LrgB family protein  39.91 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  33.94 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  37.21 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5232  antiholin-like protein LrgB  38.81 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  37.21 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  37.9 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  34.58 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0811  putative effector of murein hydrolase  36.74 
 
 		 232 aa  143  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00607912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  34.51 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  34.51 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  34.51 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  34.51 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1268  LrgB family protein  35.51 
 
 		 244 aa  141  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  34.51 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  31.7 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  33.48 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  33.48 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  33.48 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  36.02 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  33.48 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  33.48 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  33.48 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  33.48 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  33.48 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1794  LrgB-like protein  35.82 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  31.7 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  33.93 
 
 		 231 aa  138  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  33.93 
 
 		 231 aa  138  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0853  hypothetical protein  34.43 
 
 		 224 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1148  hypothetical protein  38.36 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000875943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  33.48 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  32.14 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2027  antiholin-like protein LrgB  35.15 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.69711  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1100  putative inner membrane protein yohK  35 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003698  lrgA-associated membrane protein LrgB  36.79 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  32.14 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  32.14 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3808  LrgB family protein  31.56 
 
 		 238 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0623  LrgB-like protein  35 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  34.12 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1954  LrgB family protein  37.06 
 
 		 239 aa  135  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  36.76 
 
 		 240 aa  134  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2322  LrgB family protein  31.08 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000117788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1577  LrgB family protein  30.81 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.4351e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  29.6 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  31.25 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2427  LrgB-like protein  33.49 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0333  LrgB-like protein  35 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2209  LrgB family protein  34.01 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal  0.130625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  33.02 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3003  LrgB family protein  32 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  37.31 
 
 		 241 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02117  murein hydrolase export regulator  37.76 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0156  LrgB family protein  33.33 
 
 		 238 aa  131  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1536  hypothetical protein  33.02 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.020516 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  31.7 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3778  hypothetical protein  33.02 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  32.09 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  32.47 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3993  LrgB family protein  30.84 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.479207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0666  LrgB family protein  32.34 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0736  hypothetical protein  30.94 
 
 		 238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3711  hypothetical protein  32.55 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.34067  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1010  LrgB family protein  34.82 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3459  hypothetical protein  32.55 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.807619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3425  murein hydrolase export regulator  32.55 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0481029  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  33.85 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3731  hypothetical protein  32.55 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0254  antiholin-like protein LrgB  33.33 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0248  antiholin-like protein LrgB  33.33 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>