More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0468 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0468  putative CheW protein  100 
 
 
186 aa  347  5e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0754564  normal  0.870958 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3534  putative CheW protein  48.63 
 
 
171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274314  normal  0.0377481 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  35.64 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  34.15 
 
 
200 aa  96.3  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  33.85 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  32.86 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  34.4 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  29.32 
 
 
200 aa  72  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  29.85 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  31.75 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  34.51 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  32.09 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  30.39 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  34.83 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  32 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  35.96 
 
 
161 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0742  CheW protein  29.32 
 
 
275 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  31.58 
 
 
146 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  36.19 
 
 
159 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  36.19 
 
 
159 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0757  CheW protein  28.57 
 
 
276 aa  62  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202103 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  27.45 
 
 
158 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  27.45 
 
 
158 aa  61.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  30.51 
 
 
164 aa  60.8  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0266  putative CheW protein  50 
 
 
177 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.452082 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  27.45 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  29.92 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  28 
 
 
163 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  38.95 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  34.23 
 
 
169 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  34.23 
 
 
169 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.11 
 
 
174 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.57 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  32.11 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  29.57 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  29.57 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  29.57 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  30.51 
 
 
164 aa  58.9  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  30.33 
 
 
161 aa  58.9  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  30.99 
 
 
178 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  26.72 
 
 
365 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  29.57 
 
 
164 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  29.57 
 
 
164 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  29.57 
 
 
164 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  24.84 
 
 
189 aa  58.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  29.57 
 
 
164 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  30.99 
 
 
178 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  34.58 
 
 
160 aa  58.2  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  36.56 
 
 
164 aa  58.2  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  33.98 
 
 
179 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  26.32 
 
 
183 aa  58.2  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.64 
 
 
164 aa  57.8  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  35.56 
 
 
159 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  29.91 
 
 
164 aa  58.2  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  28.32 
 
 
154 aa  57.8  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  55 
 
 
178 aa  57.8  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  32.54 
 
 
174 aa  57.8  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  29.31 
 
 
164 aa  57.8  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.48 
 
 
159 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  32.11 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  36.56 
 
 
159 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  55 
 
 
178 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  35.48 
 
 
159 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  32.71 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  35.48 
 
 
159 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  29.67 
 
 
159 aa  57.4  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  34.74 
 
 
163 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  35.48 
 
 
159 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.51 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  34.41 
 
 
162 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  29.17 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  31.96 
 
 
165 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.64 
 
 
164 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  29.71 
 
 
141 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  36.67 
 
 
159 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  30 
 
 
147 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  27.87 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  33.63 
 
 
185 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  31.54 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  29.55 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  31.07 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  33.33 
 
 
159 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  31.19 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  28.38 
 
 
165 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  26.09 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  25 
 
 
141 aa  55.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  32.18 
 
 
141 aa  56.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  31.11 
 
 
262 aa  56.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  32.29 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  29.41 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  33.01 
 
 
179 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  33.01 
 
 
179 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  29.36 
 
 
907 aa  55.5  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  39.53 
 
 
568 aa  55.5  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  25.41 
 
 
187 aa  55.5  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  34.41 
 
 
161 aa  55.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  33.04 
 
 
185 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  29.67 
 
 
141 aa  55.1  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 
159 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  31.62 
 
 
479 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.948049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>